Protein–RNA interactions for Protein: J3KMR8

Gm17535, Predicted gene, 17535, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17535J3KMR8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm17535J3KMR8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm17535J3KMR8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm17535J3KMR8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm17535J3KMR8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm17535J3KMR8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gm17535J3KMR8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gm17535J3KMR8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm17535J3KMR8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm17535J3KMR8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm17535J3KMR8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm17535J3KMR8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm17535J3KMR8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm17535J3KMR8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm17535J3KMR8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm17535J3KMR8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm17535J3KMR8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm17535J3KMR8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm17535J3KMR8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm17535J3KMR8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm17535J3KMR8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm17535J3KMR8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm17535J3KMR8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm17535J3KMR8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm17535J3KMR8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm17535J3KMR8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm17535J3KMR8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm17535J3KMR8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm17535J3KMR8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm17535J3KMR8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm17535J3KMR8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm17535J3KMR8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm17535J3KMR8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm17535J3KMR8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm17535J3KMR8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm17535J3KMR8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm17535J3KMR8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm17535J3KMR8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm17535J3KMR8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm17535J3KMR8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gm17535J3KMR8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm17535J3KMR8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm17535J3KMR8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm17535J3KMR8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm17535J3KMR8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm17535J3KMR8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm17535J3KMR8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm17535J3KMR8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm17535J3KMR8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm17535J3KMR8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm17535J3KMR8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm17535J3KMR8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm17535J3KMR8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm17535J3KMR8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm17535J3KMR8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm17535J3KMR8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm17535J3KMR8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm17535J3KMR8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm17535J3KMR8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm17535J3KMR8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm17535J3KMR8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm17535J3KMR8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm17535J3KMR8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm17535J3KMR8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm17535J3KMR8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm17535J3KMR8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm17535J3KMR8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm17535J3KMR8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm17535J3KMR8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm17535J3KMR8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm17535J3KMR8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm17535J3KMR8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm17535J3KMR8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm17535J3KMR8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm17535J3KMR8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm17535J3KMR8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm17535J3KMR8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm17535J3KMR8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm17535J3KMR8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm17535J3KMR8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm17535J3KMR8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm17535J3KMR8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm17535J3KMR8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm17535J3KMR8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm17535J3KMR8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm17535J3KMR8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm17535J3KMR8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm17535J3KMR8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm17535J3KMR8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm17535J3KMR8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm17535J3KMR8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm17535J3KMR8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gm17535J3KMR8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gm17535J3KMR8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm17535J3KMR8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm17535J3KMR8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm17535J3KMR8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm17535J3KMR8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm17535J3KMR8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm17535J3KMR8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms