Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pot1bH7BX60 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pot1bH7BX60 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pot1bH7BX60 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pot1bH7BX60 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pot1bH7BX60 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pot1bH7BX60 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pot1bH7BX60 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pot1bH7BX60 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pot1bH7BX60 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pot1bH7BX60 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pot1bH7BX60 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pot1bH7BX60 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pot1bH7BX60 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pot1bH7BX60 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pot1bH7BX60 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pot1bH7BX60 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pot1bH7BX60 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pot1bH7BX60 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pot1bH7BX60 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pot1bH7BX60 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pot1bH7BX60 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pot1bH7BX60 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pot1bH7BX60 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pot1bH7BX60 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pot1bH7BX60 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pot1bH7BX60 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pot1bH7BX60 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pot1bH7BX60 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pot1bH7BX60 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pot1bH7BX60 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pot1bH7BX60 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pot1bH7BX60 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pot1bH7BX60 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pot1bH7BX60 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pot1bH7BX60 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pot1bH7BX60 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Pot1bH7BX60 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pot1bH7BX60 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pot1bH7BX60 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pot1bH7BX60 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pot1bH7BX60 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pot1bH7BX60 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pot1bH7BX60 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pot1bH7BX60 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pot1bH7BX60 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pot1bH7BX60 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pot1bH7BX60 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pot1bH7BX60 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pot1bH7BX60 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pot1bH7BX60 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pot1bH7BX60 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pot1bH7BX60 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pot1bH7BX60 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pot1bH7BX60 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pot1bH7BX60 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pot1bH7BX60 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pot1bH7BX60 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pot1bH7BX60 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pot1bH7BX60 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pot1bH7BX60 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pot1bH7BX60 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pot1bH7BX60 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pot1bH7BX60 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pot1bH7BX60 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pot1bH7BX60 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pot1bH7BX60 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pot1bH7BX60 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pot1bH7BX60 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pot1bH7BX60 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pot1bH7BX60 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pot1bH7BX60 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pot1bH7BX60 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pot1bH7BX60 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pot1bH7BX60 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pot1bH7BX60 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pot1bH7BX60 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pot1bH7BX60 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pot1bH7BX60 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pot1bH7BX60 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pot1bH7BX60 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pot1bH7BX60 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pot1bH7BX60 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pot1bH7BX60 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pot1bH7BX60 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pot1bH7BX60 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pot1bH7BX60 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pot1bH7BX60 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pot1bH7BX60 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pot1bH7BX60 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pot1bH7BX60 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pot1bH7BX60 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pot1bH7BX60 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pot1bH7BX60 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pot1bH7BX60 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pot1bH7BX60 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pot1bH7BX60 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pot1bH7BX60 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pot1bH7BX60 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pot1bH7BX60 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms