Protein–RNA interactions for Protein: G3X9N3

Pnmal2, MCG16539, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnmal2G3X9N3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pnmal2G3X9N3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pnmal2G3X9N3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pnmal2G3X9N3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pnmal2G3X9N3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pnmal2G3X9N3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pnmal2G3X9N3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pnmal2G3X9N3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pnmal2G3X9N3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pnmal2G3X9N3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pnmal2G3X9N3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pnmal2G3X9N3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pnmal2G3X9N3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pnmal2G3X9N3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pnmal2G3X9N3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pnmal2G3X9N3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pnmal2G3X9N3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pnmal2G3X9N3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pnmal2G3X9N3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pnmal2G3X9N3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pnmal2G3X9N3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pnmal2G3X9N3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pnmal2G3X9N3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pnmal2G3X9N3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pnmal2G3X9N3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pnmal2G3X9N3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pnmal2G3X9N3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Pnmal2G3X9N3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Pnmal2G3X9N3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pnmal2G3X9N3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pnmal2G3X9N3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pnmal2G3X9N3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pnmal2G3X9N3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pnmal2G3X9N3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pnmal2G3X9N3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pnmal2G3X9N3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Pnmal2G3X9N3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pnmal2G3X9N3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pnmal2G3X9N3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pnmal2G3X9N3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pnmal2G3X9N3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pnmal2G3X9N3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pnmal2G3X9N3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pnmal2G3X9N3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pnmal2G3X9N3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pnmal2G3X9N3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pnmal2G3X9N3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pnmal2G3X9N3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pnmal2G3X9N3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pnmal2G3X9N3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pnmal2G3X9N3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pnmal2G3X9N3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pnmal2G3X9N3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pnmal2G3X9N3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pnmal2G3X9N3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pnmal2G3X9N3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pnmal2G3X9N3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pnmal2G3X9N3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pnmal2G3X9N3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pnmal2G3X9N3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Pnmal2G3X9N3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pnmal2G3X9N3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pnmal2G3X9N3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pnmal2G3X9N3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pnmal2G3X9N3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pnmal2G3X9N3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pnmal2G3X9N3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pnmal2G3X9N3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pnmal2G3X9N3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pnmal2G3X9N3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pnmal2G3X9N3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pnmal2G3X9N3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pnmal2G3X9N3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pnmal2G3X9N3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pnmal2G3X9N3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pnmal2G3X9N3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pnmal2G3X9N3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pnmal2G3X9N3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pnmal2G3X9N3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pnmal2G3X9N3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pnmal2G3X9N3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pnmal2G3X9N3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pnmal2G3X9N3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Pnmal2G3X9N3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pnmal2G3X9N3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pnmal2G3X9N3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pnmal2G3X9N3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pnmal2G3X9N3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pnmal2G3X9N3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pnmal2G3X9N3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pnmal2G3X9N3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Pnmal2G3X9N3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pnmal2G3X9N3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pnmal2G3X9N3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Pnmal2G3X9N3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pnmal2G3X9N3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pnmal2G3X9N3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pnmal2G3X9N3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pnmal2G3X9N3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pnmal2G3X9N3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms