Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chrna9G3X8Z7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chrna9G3X8Z7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chrna9G3X8Z7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chrna9G3X8Z7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chrna9G3X8Z7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chrna9G3X8Z7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chrna9G3X8Z7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chrna9G3X8Z7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chrna9G3X8Z7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chrna9G3X8Z7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chrna9G3X8Z7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Chrna9G3X8Z7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chrna9G3X8Z7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chrna9G3X8Z7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chrna9G3X8Z7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chrna9G3X8Z7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chrna9G3X8Z7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chrna9G3X8Z7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Chrna9G3X8Z7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chrna9G3X8Z7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chrna9G3X8Z7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chrna9G3X8Z7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chrna9G3X8Z7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chrna9G3X8Z7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chrna9G3X8Z7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chrna9G3X8Z7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chrna9G3X8Z7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chrna9G3X8Z7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Chrna9G3X8Z7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chrna9G3X8Z7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chrna9G3X8Z7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chrna9G3X8Z7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chrna9G3X8Z7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chrna9G3X8Z7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chrna9G3X8Z7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Chrna9G3X8Z7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chrna9G3X8Z7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chrna9G3X8Z7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chrna9G3X8Z7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chrna9G3X8Z7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chrna9G3X8Z7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chrna9G3X8Z7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chrna9G3X8Z7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chrna9G3X8Z7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chrna9G3X8Z7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chrna9G3X8Z7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chrna9G3X8Z7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chrna9G3X8Z7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chrna9G3X8Z7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chrna9G3X8Z7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chrna9G3X8Z7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chrna9G3X8Z7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chrna9G3X8Z7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chrna9G3X8Z7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chrna9G3X8Z7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Chrna9G3X8Z7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chrna9G3X8Z7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chrna9G3X8Z7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chrna9G3X8Z7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chrna9G3X8Z7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chrna9G3X8Z7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chrna9G3X8Z7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chrna9G3X8Z7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chrna9G3X8Z7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chrna9G3X8Z7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chrna9G3X8Z7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chrna9G3X8Z7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chrna9G3X8Z7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chrna9G3X8Z7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chrna9G3X8Z7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chrna9G3X8Z7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chrna9G3X8Z7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chrna9G3X8Z7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chrna9G3X8Z7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chrna9G3X8Z7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chrna9G3X8Z7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chrna9G3X8Z7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chrna9G3X8Z7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chrna9G3X8Z7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Chrna9G3X8Z7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chrna9G3X8Z7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chrna9G3X8Z7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chrna9G3X8Z7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chrna9G3X8Z7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chrna9G3X8Z7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chrna9G3X8Z7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chrna9G3X8Z7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chrna9G3X8Z7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chrna9G3X8Z7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chrna9G3X8Z7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chrna9G3X8Z7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chrna9G3X8Z7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chrna9G3X8Z7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chrna9G3X8Z7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chrna9G3X8Z7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chrna9G3X8Z7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chrna9G3X8Z7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chrna9G3X8Z7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chrna9G3X8Z7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms