Protein–RNA interactions for Protein: G3X8R9

Tmigd3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd3G3X8R9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tmigd3G3X8R9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tmigd3G3X8R9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tmigd3G3X8R9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tmigd3G3X8R9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tmigd3G3X8R9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tmigd3G3X8R9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tmigd3G3X8R9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tmigd3G3X8R9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tmigd3G3X8R9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tmigd3G3X8R9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tmigd3G3X8R9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tmigd3G3X8R9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tmigd3G3X8R9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Tmigd3G3X8R9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tmigd3G3X8R9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tmigd3G3X8R9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tmigd3G3X8R9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tmigd3G3X8R9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tmigd3G3X8R9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tmigd3G3X8R9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Tmigd3G3X8R9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tmigd3G3X8R9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tmigd3G3X8R9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tmigd3G3X8R9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tmigd3G3X8R9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tmigd3G3X8R9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tmigd3G3X8R9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tmigd3G3X8R9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tmigd3G3X8R9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Tmigd3G3X8R9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Tmigd3G3X8R9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tmigd3G3X8R9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tmigd3G3X8R9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tmigd3G3X8R9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Tmigd3G3X8R9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tmigd3G3X8R9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tmigd3G3X8R9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tmigd3G3X8R9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tmigd3G3X8R9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Tmigd3G3X8R9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tmigd3G3X8R9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Tmigd3G3X8R9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tmigd3G3X8R9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tmigd3G3X8R9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tmigd3G3X8R9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tmigd3G3X8R9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Tmigd3G3X8R9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tmigd3G3X8R9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tmigd3G3X8R9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tmigd3G3X8R9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tmigd3G3X8R9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tmigd3G3X8R9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tmigd3G3X8R9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tmigd3G3X8R9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tmigd3G3X8R9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tmigd3G3X8R9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tmigd3G3X8R9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tmigd3G3X8R9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tmigd3G3X8R9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tmigd3G3X8R9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tmigd3G3X8R9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tmigd3G3X8R9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tmigd3G3X8R9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tmigd3G3X8R9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tmigd3G3X8R9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tmigd3G3X8R9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tmigd3G3X8R9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tmigd3G3X8R9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tmigd3G3X8R9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tmigd3G3X8R9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tmigd3G3X8R9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tmigd3G3X8R9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tmigd3G3X8R9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Tmigd3G3X8R9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tmigd3G3X8R9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tmigd3G3X8R9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tmigd3G3X8R9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tmigd3G3X8R9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tmigd3G3X8R9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmigd3G3X8R9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmigd3G3X8R9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmigd3G3X8R9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmigd3G3X8R9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmigd3G3X8R9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmigd3G3X8R9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmigd3G3X8R9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmigd3G3X8R9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmigd3G3X8R9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmigd3G3X8R9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmigd3G3X8R9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tmigd3G3X8R9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tmigd3G3X8R9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tmigd3G3X8R9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Tmigd3G3X8R9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tmigd3G3X8R9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tmigd3G3X8R9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tmigd3G3X8R9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Tmigd3G3X8R9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tmigd3G3X8R9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms