Protein–RNA interactions for Protein: G3UW56

Vmn2r85, MCG21565, mousemouse

Predictions only

Length 850 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r85G3UW56 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn2r85G3UW56 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn2r85G3UW56 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn2r85G3UW56 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn2r85G3UW56 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn2r85G3UW56 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn2r85G3UW56 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn2r85G3UW56 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn2r85G3UW56 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn2r85G3UW56 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn2r85G3UW56 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn2r85G3UW56 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn2r85G3UW56 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn2r85G3UW56 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn2r85G3UW56 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn2r85G3UW56 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vmn2r85G3UW56 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn2r85G3UW56 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn2r85G3UW56 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn2r85G3UW56 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn2r85G3UW56 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn2r85G3UW56 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn2r85G3UW56 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn2r85G3UW56 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn2r85G3UW56 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn2r85G3UW56 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn2r85G3UW56 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn2r85G3UW56 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn2r85G3UW56 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn2r85G3UW56 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn2r85G3UW56 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn2r85G3UW56 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn2r85G3UW56 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn2r85G3UW56 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn2r85G3UW56 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn2r85G3UW56 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn2r85G3UW56 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn2r85G3UW56 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn2r85G3UW56 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn2r85G3UW56 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn2r85G3UW56 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn2r85G3UW56 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn2r85G3UW56 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn2r85G3UW56 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn2r85G3UW56 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn2r85G3UW56 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn2r85G3UW56 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn2r85G3UW56 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn2r85G3UW56 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn2r85G3UW56 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn2r85G3UW56 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn2r85G3UW56 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn2r85G3UW56 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn2r85G3UW56 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn2r85G3UW56 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn2r85G3UW56 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn2r85G3UW56 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn2r85G3UW56 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn2r85G3UW56 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn2r85G3UW56 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn2r85G3UW56 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn2r85G3UW56 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn2r85G3UW56 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn2r85G3UW56 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn2r85G3UW56 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn2r85G3UW56 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn2r85G3UW56 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn2r85G3UW56 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn2r85G3UW56 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn2r85G3UW56 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn2r85G3UW56 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn2r85G3UW56 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn2r85G3UW56 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn2r85G3UW56 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn2r85G3UW56 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn2r85G3UW56 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn2r85G3UW56 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn2r85G3UW56 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn2r85G3UW56 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn2r85G3UW56 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn2r85G3UW56 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn2r85G3UW56 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn2r85G3UW56 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn2r85G3UW56 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn2r85G3UW56 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn2r85G3UW56 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn2r85G3UW56 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn2r85G3UW56 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn2r85G3UW56 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn2r85G3UW56 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn2r85G3UW56 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn2r85G3UW56 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn2r85G3UW56 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn2r85G3UW56 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn2r85G3UW56 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn2r85G3UW56 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn2r85G3UW56 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn2r85G3UW56 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn2r85G3UW56 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn2r85G3UW56 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms