Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp9yF8VPU6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp9yF8VPU6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp9yF8VPU6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp9yF8VPU6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp9yF8VPU6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp9yF8VPU6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp9yF8VPU6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp9yF8VPU6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp9yF8VPU6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp9yF8VPU6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp9yF8VPU6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp9yF8VPU6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp9yF8VPU6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp9yF8VPU6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp9yF8VPU6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp9yF8VPU6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp9yF8VPU6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp9yF8VPU6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp9yF8VPU6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp9yF8VPU6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp9yF8VPU6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp9yF8VPU6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp9yF8VPU6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp9yF8VPU6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp9yF8VPU6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp9yF8VPU6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp9yF8VPU6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp9yF8VPU6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp9yF8VPU6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp9yF8VPU6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp9yF8VPU6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp9yF8VPU6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp9yF8VPU6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp9yF8VPU6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp9yF8VPU6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp9yF8VPU6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp9yF8VPU6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp9yF8VPU6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp9yF8VPU6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp9yF8VPU6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp9yF8VPU6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp9yF8VPU6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp9yF8VPU6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp9yF8VPU6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp9yF8VPU6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp9yF8VPU6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp9yF8VPU6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp9yF8VPU6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp9yF8VPU6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp9yF8VPU6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp9yF8VPU6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp9yF8VPU6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp9yF8VPU6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp9yF8VPU6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp9yF8VPU6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp9yF8VPU6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp9yF8VPU6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp9yF8VPU6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp9yF8VPU6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp9yF8VPU6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp9yF8VPU6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp9yF8VPU6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp9yF8VPU6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp9yF8VPU6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp9yF8VPU6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp9yF8VPU6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp9yF8VPU6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp9yF8VPU6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp9yF8VPU6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp9yF8VPU6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp9yF8VPU6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp9yF8VPU6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp9yF8VPU6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp9yF8VPU6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp9yF8VPU6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp9yF8VPU6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp9yF8VPU6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp9yF8VPU6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp9yF8VPU6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp9yF8VPU6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp9yF8VPU6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp9yF8VPU6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp9yF8VPU6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp9yF8VPU6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp9yF8VPU6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp9yF8VPU6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp9yF8VPU6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp9yF8VPU6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp9yF8VPU6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp9yF8VPU6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp9yF8VPU6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp9yF8VPU6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp9yF8VPU6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp9yF8VPU6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp9yF8VPU6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp9yF8VPU6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp9yF8VPU6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp9yF8VPU6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp9yF8VPU6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.1 ms