Protein–RNA interactions for Protein: F8VPP0

Zfp708, Zinc finger protein 708, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp708F8VPP0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp708F8VPP0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp708F8VPP0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp708F8VPP0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp708F8VPP0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp708F8VPP0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp708F8VPP0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Zfp708F8VPP0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zfp708F8VPP0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zfp708F8VPP0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zfp708F8VPP0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zfp708F8VPP0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp708F8VPP0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp708F8VPP0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp708F8VPP0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp708F8VPP0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zfp708F8VPP0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zfp708F8VPP0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zfp708F8VPP0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zfp708F8VPP0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Zfp708F8VPP0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zfp708F8VPP0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zfp708F8VPP0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zfp708F8VPP0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zfp708F8VPP0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zfp708F8VPP0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zfp708F8VPP0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zfp708F8VPP0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp708F8VPP0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp708F8VPP0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zfp708F8VPP0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Zfp708F8VPP0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zfp708F8VPP0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zfp708F8VPP0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zfp708F8VPP0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zfp708F8VPP0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Zfp708F8VPP0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Zfp708F8VPP0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp708F8VPP0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp708F8VPP0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp708F8VPP0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp708F8VPP0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp708F8VPP0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp708F8VPP0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp708F8VPP0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp708F8VPP0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp708F8VPP0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp708F8VPP0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp708F8VPP0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp708F8VPP0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp708F8VPP0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp708F8VPP0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp708F8VPP0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp708F8VPP0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp708F8VPP0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp708F8VPP0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp708F8VPP0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp708F8VPP0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp708F8VPP0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp708F8VPP0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp708F8VPP0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp708F8VPP0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp708F8VPP0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp708F8VPP0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp708F8VPP0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp708F8VPP0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp708F8VPP0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp708F8VPP0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp708F8VPP0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp708F8VPP0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp708F8VPP0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp708F8VPP0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp708F8VPP0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp708F8VPP0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp708F8VPP0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp708F8VPP0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp708F8VPP0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp708F8VPP0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp708F8VPP0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp708F8VPP0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp708F8VPP0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp708F8VPP0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp708F8VPP0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp708F8VPP0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp708F8VPP0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp708F8VPP0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp708F8VPP0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp708F8VPP0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp708F8VPP0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp708F8VPP0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp708F8VPP0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp708F8VPP0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp708F8VPP0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp708F8VPP0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp708F8VPP0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp708F8VPP0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp708F8VPP0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp708F8VPP0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp708F8VPP0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp708F8VPP0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms