Protein–RNA interactions for Protein: F6VZZ1

Gm1758, Predicted gene 1758, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1758F6VZZ1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm1758F6VZZ1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm1758F6VZZ1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm1758F6VZZ1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm1758F6VZZ1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm1758F6VZZ1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm1758F6VZZ1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm1758F6VZZ1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm1758F6VZZ1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm1758F6VZZ1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm1758F6VZZ1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm1758F6VZZ1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm1758F6VZZ1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm1758F6VZZ1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm1758F6VZZ1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm1758F6VZZ1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm1758F6VZZ1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm1758F6VZZ1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm1758F6VZZ1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm1758F6VZZ1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm1758F6VZZ1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm1758F6VZZ1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm1758F6VZZ1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm1758F6VZZ1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm1758F6VZZ1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm1758F6VZZ1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm1758F6VZZ1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm1758F6VZZ1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm1758F6VZZ1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm1758F6VZZ1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm1758F6VZZ1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm1758F6VZZ1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm1758F6VZZ1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm1758F6VZZ1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm1758F6VZZ1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm1758F6VZZ1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm1758F6VZZ1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gm1758F6VZZ1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm1758F6VZZ1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm1758F6VZZ1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm1758F6VZZ1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm1758F6VZZ1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm1758F6VZZ1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm1758F6VZZ1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm1758F6VZZ1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm1758F6VZZ1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm1758F6VZZ1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm1758F6VZZ1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm1758F6VZZ1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm1758F6VZZ1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm1758F6VZZ1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm1758F6VZZ1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm1758F6VZZ1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm1758F6VZZ1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm1758F6VZZ1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm1758F6VZZ1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm1758F6VZZ1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm1758F6VZZ1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm1758F6VZZ1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm1758F6VZZ1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm1758F6VZZ1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm1758F6VZZ1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm1758F6VZZ1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm1758F6VZZ1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm1758F6VZZ1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm1758F6VZZ1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm1758F6VZZ1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm1758F6VZZ1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm1758F6VZZ1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm1758F6VZZ1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm1758F6VZZ1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm1758F6VZZ1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm1758F6VZZ1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm1758F6VZZ1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gm1758F6VZZ1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gm1758F6VZZ1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm1758F6VZZ1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm1758F6VZZ1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm1758F6VZZ1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm1758F6VZZ1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm1758F6VZZ1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm1758F6VZZ1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm1758F6VZZ1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm1758F6VZZ1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm1758F6VZZ1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm1758F6VZZ1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm1758F6VZZ1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm1758F6VZZ1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm1758F6VZZ1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm1758F6VZZ1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm1758F6VZZ1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm1758F6VZZ1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm1758F6VZZ1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm1758F6VZZ1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm1758F6VZZ1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm1758F6VZZ1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm1758F6VZZ1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm1758F6VZZ1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm1758F6VZZ1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm1758F6VZZ1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms