Protein–RNA interactions for Protein: E9QAF1

Spata31d1c, Spermatogenesis-associated 31 subfamily D, member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata31d1cE9QAF1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spata31d1cE9QAF1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spata31d1cE9QAF1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spata31d1cE9QAF1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spata31d1cE9QAF1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spata31d1cE9QAF1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spata31d1cE9QAF1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spata31d1cE9QAF1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spata31d1cE9QAF1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spata31d1cE9QAF1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Spata31d1cE9QAF1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spata31d1cE9QAF1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spata31d1cE9QAF1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Spata31d1cE9QAF1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Spata31d1cE9QAF1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spata31d1cE9QAF1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spata31d1cE9QAF1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Spata31d1cE9QAF1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spata31d1cE9QAF1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spata31d1cE9QAF1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spata31d1cE9QAF1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spata31d1cE9QAF1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spata31d1cE9QAF1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spata31d1cE9QAF1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spata31d1cE9QAF1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spata31d1cE9QAF1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spata31d1cE9QAF1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Spata31d1cE9QAF1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spata31d1cE9QAF1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spata31d1cE9QAF1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spata31d1cE9QAF1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spata31d1cE9QAF1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spata31d1cE9QAF1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spata31d1cE9QAF1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spata31d1cE9QAF1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spata31d1cE9QAF1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spata31d1cE9QAF1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spata31d1cE9QAF1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spata31d1cE9QAF1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spata31d1cE9QAF1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spata31d1cE9QAF1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spata31d1cE9QAF1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spata31d1cE9QAF1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spata31d1cE9QAF1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Spata31d1cE9QAF1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spata31d1cE9QAF1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spata31d1cE9QAF1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spata31d1cE9QAF1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spata31d1cE9QAF1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spata31d1cE9QAF1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Spata31d1cE9QAF1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spata31d1cE9QAF1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spata31d1cE9QAF1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spata31d1cE9QAF1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spata31d1cE9QAF1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spata31d1cE9QAF1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spata31d1cE9QAF1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spata31d1cE9QAF1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spata31d1cE9QAF1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spata31d1cE9QAF1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spata31d1cE9QAF1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spata31d1cE9QAF1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spata31d1cE9QAF1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spata31d1cE9QAF1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spata31d1cE9QAF1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spata31d1cE9QAF1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spata31d1cE9QAF1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spata31d1cE9QAF1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spata31d1cE9QAF1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spata31d1cE9QAF1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spata31d1cE9QAF1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spata31d1cE9QAF1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spata31d1cE9QAF1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spata31d1cE9QAF1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spata31d1cE9QAF1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spata31d1cE9QAF1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spata31d1cE9QAF1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spata31d1cE9QAF1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spata31d1cE9QAF1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Spata31d1cE9QAF1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Spata31d1cE9QAF1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spata31d1cE9QAF1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spata31d1cE9QAF1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Spata31d1cE9QAF1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spata31d1cE9QAF1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spata31d1cE9QAF1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spata31d1cE9QAF1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spata31d1cE9QAF1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spata31d1cE9QAF1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spata31d1cE9QAF1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spata31d1cE9QAF1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spata31d1cE9QAF1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spata31d1cE9QAF1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spata31d1cE9QAF1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spata31d1cE9QAF1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spata31d1cE9QAF1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spata31d1cE9QAF1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spata31d1cE9QAF1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spata31d1cE9QAF1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spata31d1cE9QAF1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1754.3 ms