Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9R3

4930451I11Rik, RIKEN cDNA 4930451I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930451I11RikE9Q9R3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930451I11RikE9Q9R3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
4930451I11RikE9Q9R3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930451I11RikE9Q9R3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930451I11RikE9Q9R3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930451I11RikE9Q9R3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930451I11RikE9Q9R3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
4930451I11RikE9Q9R3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930451I11RikE9Q9R3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930451I11RikE9Q9R3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930451I11RikE9Q9R3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930451I11RikE9Q9R3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930451I11RikE9Q9R3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930451I11RikE9Q9R3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930451I11RikE9Q9R3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
4930451I11RikE9Q9R3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
4930451I11RikE9Q9R3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930451I11RikE9Q9R3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930451I11RikE9Q9R3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930451I11RikE9Q9R3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930451I11RikE9Q9R3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930451I11RikE9Q9R3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930451I11RikE9Q9R3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930451I11RikE9Q9R3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930451I11RikE9Q9R3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930451I11RikE9Q9R3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930451I11RikE9Q9R3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930451I11RikE9Q9R3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930451I11RikE9Q9R3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930451I11RikE9Q9R3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
4930451I11RikE9Q9R3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
4930451I11RikE9Q9R3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930451I11RikE9Q9R3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930451I11RikE9Q9R3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930451I11RikE9Q9R3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930451I11RikE9Q9R3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930451I11RikE9Q9R3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930451I11RikE9Q9R3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930451I11RikE9Q9R3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930451I11RikE9Q9R3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930451I11RikE9Q9R3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930451I11RikE9Q9R3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930451I11RikE9Q9R3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930451I11RikE9Q9R3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930451I11RikE9Q9R3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930451I11RikE9Q9R3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930451I11RikE9Q9R3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930451I11RikE9Q9R3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
4930451I11RikE9Q9R3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930451I11RikE9Q9R3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930451I11RikE9Q9R3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930451I11RikE9Q9R3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930451I11RikE9Q9R3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
4930451I11RikE9Q9R3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930451I11RikE9Q9R3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930451I11RikE9Q9R3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930451I11RikE9Q9R3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930451I11RikE9Q9R3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930451I11RikE9Q9R3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930451I11RikE9Q9R3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
4930451I11RikE9Q9R3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930451I11RikE9Q9R3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930451I11RikE9Q9R3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930451I11RikE9Q9R3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930451I11RikE9Q9R3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
4930451I11RikE9Q9R3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930451I11RikE9Q9R3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930451I11RikE9Q9R3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930451I11RikE9Q9R3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930451I11RikE9Q9R3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930451I11RikE9Q9R3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930451I11RikE9Q9R3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
4930451I11RikE9Q9R3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930451I11RikE9Q9R3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930451I11RikE9Q9R3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
4930451I11RikE9Q9R3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
4930451I11RikE9Q9R3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930451I11RikE9Q9R3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930451I11RikE9Q9R3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
4930451I11RikE9Q9R3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930451I11RikE9Q9R3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930451I11RikE9Q9R3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
4930451I11RikE9Q9R3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930451I11RikE9Q9R3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930451I11RikE9Q9R3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930451I11RikE9Q9R3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930451I11RikE9Q9R3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930451I11RikE9Q9R3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930451I11RikE9Q9R3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
4930451I11RikE9Q9R3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930451I11RikE9Q9R3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930451I11RikE9Q9R3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930451I11RikE9Q9R3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930451I11RikE9Q9R3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930451I11RikE9Q9R3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930451I11RikE9Q9R3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930451I11RikE9Q9R3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930451I11RikE9Q9R3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930451I11RikE9Q9R3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930451I11RikE9Q9R3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms