Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7D5

Arhgef5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef5E9Q7D5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Arhgef5E9Q7D5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
Arhgef5E9Q7D5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Arhgef5E9Q7D5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Arhgef5E9Q7D5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
Arhgef5E9Q7D5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC37.83■■■■□ 3.65
Arhgef5E9Q7D5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Arhgef5E9Q7D5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
Arhgef5E9Q7D5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
Arhgef5E9Q7D5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Arhgef5E9Q7D5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Arhgef5E9Q7D5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
Arhgef5E9Q7D5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Arhgef5E9Q7D5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
Arhgef5E9Q7D5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Arhgef5E9Q7D5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Arhgef5E9Q7D5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
Arhgef5E9Q7D5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Arhgef5E9Q7D5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Arhgef5E9Q7D5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Arhgef5E9Q7D5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Arhgef5E9Q7D5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Arhgef5E9Q7D5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Arhgef5E9Q7D5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC37.76■■■■□ 3.64
Arhgef5E9Q7D5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Arhgef5E9Q7D5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
Arhgef5E9Q7D5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
Arhgef5E9Q7D5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC37.76■■■■□ 3.63
Arhgef5E9Q7D5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Arhgef5E9Q7D5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Arhgef5E9Q7D5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Arhgef5E9Q7D5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
Arhgef5E9Q7D5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Arhgef5E9Q7D5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Arhgef5E9Q7D5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Arhgef5E9Q7D5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Arhgef5E9Q7D5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Arhgef5E9Q7D5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Arhgef5E9Q7D5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Arhgef5E9Q7D5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Arhgef5E9Q7D5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Arhgef5E9Q7D5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
Arhgef5E9Q7D5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Arhgef5E9Q7D5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Arhgef5E9Q7D5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Arhgef5E9Q7D5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Arhgef5E9Q7D5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
Arhgef5E9Q7D5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Arhgef5E9Q7D5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Arhgef5E9Q7D5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Arhgef5E9Q7D5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Arhgef5E9Q7D5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Arhgef5E9Q7D5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
Arhgef5E9Q7D5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Arhgef5E9Q7D5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Arhgef5E9Q7D5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.62
Arhgef5E9Q7D5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
Arhgef5E9Q7D5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Arhgef5E9Q7D5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Arhgef5E9Q7D5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Arhgef5E9Q7D5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Arhgef5E9Q7D5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Arhgef5E9Q7D5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Arhgef5E9Q7D5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
Arhgef5E9Q7D5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Arhgef5E9Q7D5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Arhgef5E9Q7D5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Arhgef5E9Q7D5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Arhgef5E9Q7D5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Arhgef5E9Q7D5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Arhgef5E9Q7D5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Arhgef5E9Q7D5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Arhgef5E9Q7D5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Arhgef5E9Q7D5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Arhgef5E9Q7D5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC37.51■■■■□ 3.59
Arhgef5E9Q7D5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Arhgef5E9Q7D5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC37.51■■■■□ 3.59
Arhgef5E9Q7D5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Arhgef5E9Q7D5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Arhgef5E9Q7D5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Arhgef5E9Q7D5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Arhgef5E9Q7D5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
Arhgef5E9Q7D5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Arhgef5E9Q7D5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Arhgef5E9Q7D5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Arhgef5E9Q7D5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Arhgef5E9Q7D5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Arhgef5E9Q7D5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Arhgef5E9Q7D5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Arhgef5E9Q7D5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Arhgef5E9Q7D5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Arhgef5E9Q7D5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
Arhgef5E9Q7D5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC37.45■■■■□ 3.58
Arhgef5E9Q7D5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Arhgef5E9Q7D5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Arhgef5E9Q7D5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
Arhgef5E9Q7D5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
Arhgef5E9Q7D5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Arhgef5E9Q7D5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Arhgef5E9Q7D5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms