Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6S4

Gm17067, Predicted gene 17067, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17067E9Q6S4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm17067E9Q6S4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm17067E9Q6S4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm17067E9Q6S4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm17067E9Q6S4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm17067E9Q6S4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm17067E9Q6S4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm17067E9Q6S4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm17067E9Q6S4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm17067E9Q6S4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm17067E9Q6S4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm17067E9Q6S4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm17067E9Q6S4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm17067E9Q6S4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm17067E9Q6S4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm17067E9Q6S4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm17067E9Q6S4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm17067E9Q6S4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm17067E9Q6S4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm17067E9Q6S4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm17067E9Q6S4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm17067E9Q6S4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm17067E9Q6S4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm17067E9Q6S4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm17067E9Q6S4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm17067E9Q6S4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm17067E9Q6S4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm17067E9Q6S4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm17067E9Q6S4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm17067E9Q6S4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm17067E9Q6S4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm17067E9Q6S4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm17067E9Q6S4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm17067E9Q6S4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm17067E9Q6S4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm17067E9Q6S4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm17067E9Q6S4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm17067E9Q6S4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm17067E9Q6S4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm17067E9Q6S4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm17067E9Q6S4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm17067E9Q6S4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm17067E9Q6S4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm17067E9Q6S4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm17067E9Q6S4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm17067E9Q6S4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm17067E9Q6S4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm17067E9Q6S4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm17067E9Q6S4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm17067E9Q6S4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm17067E9Q6S4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm17067E9Q6S4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm17067E9Q6S4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm17067E9Q6S4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gm17067E9Q6S4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm17067E9Q6S4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm17067E9Q6S4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm17067E9Q6S4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm17067E9Q6S4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm17067E9Q6S4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm17067E9Q6S4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm17067E9Q6S4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm17067E9Q6S4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm17067E9Q6S4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm17067E9Q6S4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm17067E9Q6S4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm17067E9Q6S4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm17067E9Q6S4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm17067E9Q6S4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm17067E9Q6S4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm17067E9Q6S4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm17067E9Q6S4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm17067E9Q6S4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm17067E9Q6S4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm17067E9Q6S4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm17067E9Q6S4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm17067E9Q6S4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm17067E9Q6S4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm17067E9Q6S4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm17067E9Q6S4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm17067E9Q6S4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm17067E9Q6S4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm17067E9Q6S4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm17067E9Q6S4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm17067E9Q6S4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm17067E9Q6S4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm17067E9Q6S4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm17067E9Q6S4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm17067E9Q6S4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm17067E9Q6S4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm17067E9Q6S4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm17067E9Q6S4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm17067E9Q6S4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm17067E9Q6S4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm17067E9Q6S4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm17067E9Q6S4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm17067E9Q6S4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm17067E9Q6S4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm17067E9Q6S4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm17067E9Q6S4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms