Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5D8

Vmn2r48, Vomeronasal 2, receptor 48, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r48E9Q5D8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn2r48E9Q5D8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn2r48E9Q5D8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn2r48E9Q5D8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn2r48E9Q5D8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn2r48E9Q5D8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn2r48E9Q5D8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vmn2r48E9Q5D8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vmn2r48E9Q5D8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vmn2r48E9Q5D8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vmn2r48E9Q5D8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vmn2r48E9Q5D8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vmn2r48E9Q5D8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn2r48E9Q5D8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn2r48E9Q5D8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn2r48E9Q5D8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn2r48E9Q5D8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn2r48E9Q5D8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn2r48E9Q5D8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn2r48E9Q5D8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn2r48E9Q5D8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn2r48E9Q5D8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn2r48E9Q5D8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn2r48E9Q5D8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn2r48E9Q5D8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn2r48E9Q5D8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn2r48E9Q5D8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn2r48E9Q5D8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn2r48E9Q5D8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmn2r48E9Q5D8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmn2r48E9Q5D8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmn2r48E9Q5D8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmn2r48E9Q5D8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmn2r48E9Q5D8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmn2r48E9Q5D8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn2r48E9Q5D8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn2r48E9Q5D8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmn2r48E9Q5D8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmn2r48E9Q5D8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmn2r48E9Q5D8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmn2r48E9Q5D8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmn2r48E9Q5D8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmn2r48E9Q5D8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmn2r48E9Q5D8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmn2r48E9Q5D8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmn2r48E9Q5D8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vmn2r48E9Q5D8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Vmn2r48E9Q5D8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vmn2r48E9Q5D8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vmn2r48E9Q5D8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmn2r48E9Q5D8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmn2r48E9Q5D8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmn2r48E9Q5D8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmn2r48E9Q5D8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vmn2r48E9Q5D8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Vmn2r48E9Q5D8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vmn2r48E9Q5D8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vmn2r48E9Q5D8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vmn2r48E9Q5D8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn2r48E9Q5D8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn2r48E9Q5D8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn2r48E9Q5D8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vmn2r48E9Q5D8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vmn2r48E9Q5D8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vmn2r48E9Q5D8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vmn2r48E9Q5D8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vmn2r48E9Q5D8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Vmn2r48E9Q5D8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmn2r48E9Q5D8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmn2r48E9Q5D8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmn2r48E9Q5D8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmn2r48E9Q5D8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmn2r48E9Q5D8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmn2r48E9Q5D8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmn2r48E9Q5D8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmn2r48E9Q5D8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmn2r48E9Q5D8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Vmn2r48E9Q5D8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vmn2r48E9Q5D8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vmn2r48E9Q5D8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vmn2r48E9Q5D8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vmn2r48E9Q5D8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vmn2r48E9Q5D8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vmn2r48E9Q5D8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vmn2r48E9Q5D8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vmn2r48E9Q5D8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vmn2r48E9Q5D8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vmn2r48E9Q5D8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vmn2r48E9Q5D8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vmn2r48E9Q5D8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vmn2r48E9Q5D8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vmn2r48E9Q5D8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vmn2r48E9Q5D8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vmn2r48E9Q5D8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vmn2r48E9Q5D8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vmn2r48E9Q5D8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vmn2r48E9Q5D8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vmn2r48E9Q5D8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vmn2r48E9Q5D8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vmn2r48E9Q5D8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms