Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4U5

Vmn2r56, Vomeronasal 2, receptor 56, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r56E9Q4U5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn2r56E9Q4U5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn2r56E9Q4U5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn2r56E9Q4U5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn2r56E9Q4U5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn2r56E9Q4U5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn2r56E9Q4U5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn2r56E9Q4U5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn2r56E9Q4U5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Vmn2r56E9Q4U5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn2r56E9Q4U5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn2r56E9Q4U5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn2r56E9Q4U5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn2r56E9Q4U5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn2r56E9Q4U5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn2r56E9Q4U5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn2r56E9Q4U5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn2r56E9Q4U5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn2r56E9Q4U5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn2r56E9Q4U5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn2r56E9Q4U5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn2r56E9Q4U5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn2r56E9Q4U5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn2r56E9Q4U5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn2r56E9Q4U5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn2r56E9Q4U5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn2r56E9Q4U5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn2r56E9Q4U5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn2r56E9Q4U5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn2r56E9Q4U5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn2r56E9Q4U5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn2r56E9Q4U5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn2r56E9Q4U5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn2r56E9Q4U5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn2r56E9Q4U5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn2r56E9Q4U5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn2r56E9Q4U5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn2r56E9Q4U5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn2r56E9Q4U5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn2r56E9Q4U5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn2r56E9Q4U5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn2r56E9Q4U5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn2r56E9Q4U5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vmn2r56E9Q4U5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vmn2r56E9Q4U5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn2r56E9Q4U5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn2r56E9Q4U5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn2r56E9Q4U5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn2r56E9Q4U5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn2r56E9Q4U5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn2r56E9Q4U5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn2r56E9Q4U5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn2r56E9Q4U5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn2r56E9Q4U5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn2r56E9Q4U5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn2r56E9Q4U5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn2r56E9Q4U5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn2r56E9Q4U5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn2r56E9Q4U5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn2r56E9Q4U5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn2r56E9Q4U5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn2r56E9Q4U5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn2r56E9Q4U5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn2r56E9Q4U5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn2r56E9Q4U5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn2r56E9Q4U5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn2r56E9Q4U5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn2r56E9Q4U5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn2r56E9Q4U5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn2r56E9Q4U5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn2r56E9Q4U5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn2r56E9Q4U5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn2r56E9Q4U5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn2r56E9Q4U5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn2r56E9Q4U5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn2r56E9Q4U5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn2r56E9Q4U5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn2r56E9Q4U5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn2r56E9Q4U5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn2r56E9Q4U5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn2r56E9Q4U5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn2r56E9Q4U5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn2r56E9Q4U5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn2r56E9Q4U5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn2r56E9Q4U5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn2r56E9Q4U5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn2r56E9Q4U5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn2r56E9Q4U5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn2r56E9Q4U5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn2r56E9Q4U5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn2r56E9Q4U5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn2r56E9Q4U5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn2r56E9Q4U5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn2r56E9Q4U5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn2r56E9Q4U5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn2r56E9Q4U5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn2r56E9Q4U5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn2r56E9Q4U5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn2r56E9Q4U5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn2r56E9Q4U5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms