Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3J7

Gm3020, Predicted gene 3020, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3020E9Q3J7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3020E9Q3J7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3020E9Q3J7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3020E9Q3J7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3020E9Q3J7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3020E9Q3J7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3020E9Q3J7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3020E9Q3J7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3020E9Q3J7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3020E9Q3J7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3020E9Q3J7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3020E9Q3J7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3020E9Q3J7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3020E9Q3J7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3020E9Q3J7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3020E9Q3J7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3020E9Q3J7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3020E9Q3J7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3020E9Q3J7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3020E9Q3J7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3020E9Q3J7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3020E9Q3J7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3020E9Q3J7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3020E9Q3J7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3020E9Q3J7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3020E9Q3J7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3020E9Q3J7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3020E9Q3J7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3020E9Q3J7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3020E9Q3J7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3020E9Q3J7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3020E9Q3J7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3020E9Q3J7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3020E9Q3J7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3020E9Q3J7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3020E9Q3J7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3020E9Q3J7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3020E9Q3J7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3020E9Q3J7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3020E9Q3J7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3020E9Q3J7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3020E9Q3J7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3020E9Q3J7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3020E9Q3J7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3020E9Q3J7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3020E9Q3J7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3020E9Q3J7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3020E9Q3J7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3020E9Q3J7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3020E9Q3J7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3020E9Q3J7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3020E9Q3J7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3020E9Q3J7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3020E9Q3J7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3020E9Q3J7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm3020E9Q3J7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm3020E9Q3J7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3020E9Q3J7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3020E9Q3J7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3020E9Q3J7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3020E9Q3J7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3020E9Q3J7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3020E9Q3J7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3020E9Q3J7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3020E9Q3J7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3020E9Q3J7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3020E9Q3J7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3020E9Q3J7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3020E9Q3J7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3020E9Q3J7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3020E9Q3J7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3020E9Q3J7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3020E9Q3J7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3020E9Q3J7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3020E9Q3J7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3020E9Q3J7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3020E9Q3J7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3020E9Q3J7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3020E9Q3J7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3020E9Q3J7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3020E9Q3J7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3020E9Q3J7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3020E9Q3J7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3020E9Q3J7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3020E9Q3J7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3020E9Q3J7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3020E9Q3J7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3020E9Q3J7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3020E9Q3J7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3020E9Q3J7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3020E9Q3J7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3020E9Q3J7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3020E9Q3J7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3020E9Q3J7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm3020E9Q3J7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3020E9Q3J7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3020E9Q3J7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3020E9Q3J7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3020E9Q3J7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3020E9Q3J7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms