Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3E1

Aldh3b2, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B2, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b2E9Q3E1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Aldh3b2E9Q3E1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aldh3b2E9Q3E1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aldh3b2E9Q3E1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aldh3b2E9Q3E1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aldh3b2E9Q3E1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aldh3b2E9Q3E1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms