Protein–RNA interactions for Protein: E9Q048

Ermard, ER membrane-associated RNA degradation, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErmardE9Q048 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ErmardE9Q048 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ErmardE9Q048 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ErmardE9Q048 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ErmardE9Q048 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ErmardE9Q048 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ErmardE9Q048 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ErmardE9Q048 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ErmardE9Q048 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ErmardE9Q048 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ErmardE9Q048 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ErmardE9Q048 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ErmardE9Q048 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ErmardE9Q048 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ErmardE9Q048 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ErmardE9Q048 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ErmardE9Q048 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ErmardE9Q048 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ErmardE9Q048 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ErmardE9Q048 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ErmardE9Q048 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ErmardE9Q048 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ErmardE9Q048 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ErmardE9Q048 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ErmardE9Q048 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ErmardE9Q048 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ErmardE9Q048 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ErmardE9Q048 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ErmardE9Q048 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ErmardE9Q048 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ErmardE9Q048 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ErmardE9Q048 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ErmardE9Q048 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ErmardE9Q048 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ErmardE9Q048 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ErmardE9Q048 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ErmardE9Q048 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ErmardE9Q048 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ErmardE9Q048 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ErmardE9Q048 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ErmardE9Q048 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ErmardE9Q048 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ErmardE9Q048 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ErmardE9Q048 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ErmardE9Q048 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ErmardE9Q048 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ErmardE9Q048 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ErmardE9Q048 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ErmardE9Q048 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ErmardE9Q048 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ErmardE9Q048 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ErmardE9Q048 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ErmardE9Q048 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ErmardE9Q048 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ErmardE9Q048 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ErmardE9Q048 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ErmardE9Q048 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ErmardE9Q048 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ErmardE9Q048 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ErmardE9Q048 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ErmardE9Q048 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ErmardE9Q048 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ErmardE9Q048 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ErmardE9Q048 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ErmardE9Q048 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ErmardE9Q048 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ErmardE9Q048 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ErmardE9Q048 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ErmardE9Q048 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ErmardE9Q048 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ErmardE9Q048 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ErmardE9Q048 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ErmardE9Q048 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ErmardE9Q048 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ErmardE9Q048 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ErmardE9Q048 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ErmardE9Q048 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ErmardE9Q048 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ErmardE9Q048 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ErmardE9Q048 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ErmardE9Q048 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ErmardE9Q048 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ErmardE9Q048 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ErmardE9Q048 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ErmardE9Q048 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ErmardE9Q048 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ErmardE9Q048 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ErmardE9Q048 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ErmardE9Q048 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ErmardE9Q048 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ErmardE9Q048 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ErmardE9Q048 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ErmardE9Q048 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ErmardE9Q048 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ErmardE9Q048 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ErmardE9Q048 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ErmardE9Q048 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ErmardE9Q048 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ErmardE9Q048 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ErmardE9Q048 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms