Protein–RNA interactions for Protein: E9PWS4

AU018091, Expressed sequence AU018091, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU018091E9PWS4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AU018091E9PWS4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AU018091E9PWS4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AU018091E9PWS4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AU018091E9PWS4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AU018091E9PWS4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AU018091E9PWS4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AU018091E9PWS4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AU018091E9PWS4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AU018091E9PWS4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AU018091E9PWS4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AU018091E9PWS4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AU018091E9PWS4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AU018091E9PWS4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AU018091E9PWS4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AU018091E9PWS4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AU018091E9PWS4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AU018091E9PWS4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AU018091E9PWS4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AU018091E9PWS4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AU018091E9PWS4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AU018091E9PWS4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AU018091E9PWS4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AU018091E9PWS4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AU018091E9PWS4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AU018091E9PWS4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AU018091E9PWS4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AU018091E9PWS4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AU018091E9PWS4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AU018091E9PWS4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AU018091E9PWS4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AU018091E9PWS4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AU018091E9PWS4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AU018091E9PWS4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AU018091E9PWS4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AU018091E9PWS4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AU018091E9PWS4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AU018091E9PWS4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
AU018091E9PWS4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AU018091E9PWS4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AU018091E9PWS4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AU018091E9PWS4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AU018091E9PWS4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AU018091E9PWS4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AU018091E9PWS4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AU018091E9PWS4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AU018091E9PWS4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AU018091E9PWS4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
AU018091E9PWS4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AU018091E9PWS4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
AU018091E9PWS4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
AU018091E9PWS4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AU018091E9PWS4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AU018091E9PWS4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AU018091E9PWS4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AU018091E9PWS4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AU018091E9PWS4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AU018091E9PWS4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AU018091E9PWS4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AU018091E9PWS4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AU018091E9PWS4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AU018091E9PWS4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AU018091E9PWS4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AU018091E9PWS4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AU018091E9PWS4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AU018091E9PWS4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AU018091E9PWS4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AU018091E9PWS4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AU018091E9PWS4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AU018091E9PWS4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AU018091E9PWS4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AU018091E9PWS4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AU018091E9PWS4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AU018091E9PWS4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AU018091E9PWS4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AU018091E9PWS4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AU018091E9PWS4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AU018091E9PWS4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AU018091E9PWS4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AU018091E9PWS4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AU018091E9PWS4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AU018091E9PWS4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AU018091E9PWS4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
AU018091E9PWS4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AU018091E9PWS4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
AU018091E9PWS4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AU018091E9PWS4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AU018091E9PWS4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AU018091E9PWS4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AU018091E9PWS4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AU018091E9PWS4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AU018091E9PWS4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AU018091E9PWS4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AU018091E9PWS4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AU018091E9PWS4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AU018091E9PWS4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AU018091E9PWS4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AU018091E9PWS4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AU018091E9PWS4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AU018091E9PWS4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms