Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Trappc8E9PWG2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Trappc8E9PWG2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Trappc8E9PWG2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Trappc8E9PWG2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Trappc8E9PWG2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Trappc8E9PWG2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Trappc8E9PWG2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Trappc8E9PWG2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Trappc8E9PWG2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Trappc8E9PWG2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Trappc8E9PWG2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
Trappc8E9PWG2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
Trappc8E9PWG2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Trappc8E9PWG2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Trappc8E9PWG2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
Trappc8E9PWG2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Trappc8E9PWG2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Trappc8E9PWG2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Trappc8E9PWG2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Trappc8E9PWG2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Trappc8E9PWG2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Trappc8E9PWG2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Trappc8E9PWG2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Trappc8E9PWG2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
Trappc8E9PWG2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Trappc8E9PWG2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Trappc8E9PWG2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
Trappc8E9PWG2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Trappc8E9PWG2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Trappc8E9PWG2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Trappc8E9PWG2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Trappc8E9PWG2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Trappc8E9PWG2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
Trappc8E9PWG2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Trappc8E9PWG2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Trappc8E9PWG2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Trappc8E9PWG2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Trappc8E9PWG2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Trappc8E9PWG2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Trappc8E9PWG2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Trappc8E9PWG2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Trappc8E9PWG2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Trappc8E9PWG2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Trappc8E9PWG2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Trappc8E9PWG2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Trappc8E9PWG2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Trappc8E9PWG2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Trappc8E9PWG2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Trappc8E9PWG2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Trappc8E9PWG2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Trappc8E9PWG2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Trappc8E9PWG2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Trappc8E9PWG2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Trappc8E9PWG2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Trappc8E9PWG2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Trappc8E9PWG2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
Trappc8E9PWG2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Trappc8E9PWG2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
Trappc8E9PWG2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Trappc8E9PWG2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Trappc8E9PWG2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Trappc8E9PWG2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Trappc8E9PWG2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Trappc8E9PWG2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Trappc8E9PWG2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Trappc8E9PWG2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Trappc8E9PWG2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
Trappc8E9PWG2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Trappc8E9PWG2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Trappc8E9PWG2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Trappc8E9PWG2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Trappc8E9PWG2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Trappc8E9PWG2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Trappc8E9PWG2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Trappc8E9PWG2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Trappc8E9PWG2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Trappc8E9PWG2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
Trappc8E9PWG2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Trappc8E9PWG2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Trappc8E9PWG2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Trappc8E9PWG2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Trappc8E9PWG2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Trappc8E9PWG2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Trappc8E9PWG2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Trappc8E9PWG2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Trappc8E9PWG2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Trappc8E9PWG2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Trappc8E9PWG2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Trappc8E9PWG2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Trappc8E9PWG2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
Trappc8E9PWG2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Trappc8E9PWG2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Trappc8E9PWG2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Trappc8E9PWG2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Trappc8E9PWG2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Trappc8E9PWG2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Trappc8E9PWG2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Trappc8E9PWG2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Trappc8E9PWG2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms