Protein–RNA interactions for Protein: E9PV98

Trim5, Tripartite motif-containing 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim5E9PV98 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trim5E9PV98 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trim5E9PV98 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trim5E9PV98 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trim5E9PV98 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trim5E9PV98 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trim5E9PV98 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trim5E9PV98 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trim5E9PV98 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trim5E9PV98 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trim5E9PV98 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Trim5E9PV98 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trim5E9PV98 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trim5E9PV98 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trim5E9PV98 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trim5E9PV98 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trim5E9PV98 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim5E9PV98 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim5E9PV98 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim5E9PV98 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim5E9PV98 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trim5E9PV98 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trim5E9PV98 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trim5E9PV98 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Trim5E9PV98 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trim5E9PV98 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trim5E9PV98 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trim5E9PV98 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trim5E9PV98 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trim5E9PV98 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trim5E9PV98 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim5E9PV98 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim5E9PV98 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trim5E9PV98 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trim5E9PV98 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim5E9PV98 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim5E9PV98 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim5E9PV98 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim5E9PV98 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim5E9PV98 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim5E9PV98 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim5E9PV98 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim5E9PV98 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trim5E9PV98 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim5E9PV98 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim5E9PV98 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim5E9PV98 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trim5E9PV98 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trim5E9PV98 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trim5E9PV98 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trim5E9PV98 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trim5E9PV98 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trim5E9PV98 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trim5E9PV98 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trim5E9PV98 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim5E9PV98 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim5E9PV98 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim5E9PV98 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim5E9PV98 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim5E9PV98 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim5E9PV98 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim5E9PV98 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim5E9PV98 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trim5E9PV98 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trim5E9PV98 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trim5E9PV98 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trim5E9PV98 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trim5E9PV98 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Trim5E9PV98 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trim5E9PV98 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim5E9PV98 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim5E9PV98 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim5E9PV98 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim5E9PV98 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim5E9PV98 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim5E9PV98 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trim5E9PV98 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trim5E9PV98 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trim5E9PV98 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trim5E9PV98 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trim5E9PV98 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trim5E9PV98 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Trim5E9PV98 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trim5E9PV98 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trim5E9PV98 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trim5E9PV98 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trim5E9PV98 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Trim5E9PV98 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trim5E9PV98 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trim5E9PV98 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trim5E9PV98 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trim5E9PV98 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trim5E9PV98 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trim5E9PV98 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim5E9PV98 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim5E9PV98 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim5E9PV98 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim5E9PV98 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trim5E9PV98 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trim5E9PV98 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms