Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5M2

Gm10110, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10110D3Z5M2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm10110D3Z5M2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm10110D3Z5M2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm10110D3Z5M2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm10110D3Z5M2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm10110D3Z5M2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm10110D3Z5M2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm10110D3Z5M2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm10110D3Z5M2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm10110D3Z5M2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm10110D3Z5M2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm10110D3Z5M2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm10110D3Z5M2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm10110D3Z5M2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm10110D3Z5M2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm10110D3Z5M2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm10110D3Z5M2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm10110D3Z5M2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm10110D3Z5M2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm10110D3Z5M2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm10110D3Z5M2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm10110D3Z5M2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm10110D3Z5M2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm10110D3Z5M2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm10110D3Z5M2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm10110D3Z5M2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm10110D3Z5M2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm10110D3Z5M2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm10110D3Z5M2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm10110D3Z5M2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm10110D3Z5M2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm10110D3Z5M2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm10110D3Z5M2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm10110D3Z5M2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm10110D3Z5M2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm10110D3Z5M2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm10110D3Z5M2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm10110D3Z5M2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm10110D3Z5M2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm10110D3Z5M2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm10110D3Z5M2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gm10110D3Z5M2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm10110D3Z5M2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm10110D3Z5M2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm10110D3Z5M2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm10110D3Z5M2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm10110D3Z5M2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm10110D3Z5M2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm10110D3Z5M2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm10110D3Z5M2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm10110D3Z5M2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm10110D3Z5M2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm10110D3Z5M2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm10110D3Z5M2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm10110D3Z5M2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm10110D3Z5M2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm10110D3Z5M2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm10110D3Z5M2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm10110D3Z5M2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm10110D3Z5M2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm10110D3Z5M2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm10110D3Z5M2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm10110D3Z5M2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm10110D3Z5M2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm10110D3Z5M2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm10110D3Z5M2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm10110D3Z5M2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm10110D3Z5M2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm10110D3Z5M2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm10110D3Z5M2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm10110D3Z5M2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm10110D3Z5M2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm10110D3Z5M2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm10110D3Z5M2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm10110D3Z5M2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm10110D3Z5M2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm10110D3Z5M2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm10110D3Z5M2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm10110D3Z5M2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm10110D3Z5M2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm10110D3Z5M2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm10110D3Z5M2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm10110D3Z5M2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm10110D3Z5M2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm10110D3Z5M2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gm10110D3Z5M2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm10110D3Z5M2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm10110D3Z5M2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm10110D3Z5M2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm10110D3Z5M2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm10110D3Z5M2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm10110D3Z5M2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm10110D3Z5M2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm10110D3Z5M2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm10110D3Z5M2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm10110D3Z5M2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm10110D3Z5M2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm10110D3Z5M2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm10110D3Z5M2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm10110D3Z5M2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150 ms