Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1H5

Cd209f, CD209f antigen, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd209fD3Z1H5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd209fD3Z1H5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd209fD3Z1H5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd209fD3Z1H5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd209fD3Z1H5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd209fD3Z1H5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd209fD3Z1H5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd209fD3Z1H5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd209fD3Z1H5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd209fD3Z1H5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd209fD3Z1H5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd209fD3Z1H5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd209fD3Z1H5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cd209fD3Z1H5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd209fD3Z1H5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd209fD3Z1H5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd209fD3Z1H5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd209fD3Z1H5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd209fD3Z1H5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd209fD3Z1H5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd209fD3Z1H5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd209fD3Z1H5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd209fD3Z1H5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd209fD3Z1H5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd209fD3Z1H5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd209fD3Z1H5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd209fD3Z1H5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd209fD3Z1H5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd209fD3Z1H5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd209fD3Z1H5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd209fD3Z1H5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd209fD3Z1H5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd209fD3Z1H5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd209fD3Z1H5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd209fD3Z1H5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd209fD3Z1H5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd209fD3Z1H5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd209fD3Z1H5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd209fD3Z1H5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd209fD3Z1H5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd209fD3Z1H5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd209fD3Z1H5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd209fD3Z1H5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd209fD3Z1H5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd209fD3Z1H5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd209fD3Z1H5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd209fD3Z1H5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd209fD3Z1H5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd209fD3Z1H5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd209fD3Z1H5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd209fD3Z1H5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd209fD3Z1H5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd209fD3Z1H5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd209fD3Z1H5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd209fD3Z1H5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd209fD3Z1H5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd209fD3Z1H5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd209fD3Z1H5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd209fD3Z1H5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd209fD3Z1H5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd209fD3Z1H5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd209fD3Z1H5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd209fD3Z1H5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd209fD3Z1H5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd209fD3Z1H5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cd209fD3Z1H5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd209fD3Z1H5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd209fD3Z1H5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cd209fD3Z1H5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd209fD3Z1H5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd209fD3Z1H5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd209fD3Z1H5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd209fD3Z1H5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd209fD3Z1H5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd209fD3Z1H5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Cd209fD3Z1H5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd209fD3Z1H5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd209fD3Z1H5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd209fD3Z1H5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd209fD3Z1H5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cd209fD3Z1H5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cd209fD3Z1H5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd209fD3Z1H5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd209fD3Z1H5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd209fD3Z1H5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd209fD3Z1H5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd209fD3Z1H5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd209fD3Z1H5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd209fD3Z1H5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd209fD3Z1H5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd209fD3Z1H5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd209fD3Z1H5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd209fD3Z1H5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd209fD3Z1H5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd209fD3Z1H5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd209fD3Z1H5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd209fD3Z1H5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd209fD3Z1H5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd209fD3Z1H5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd209fD3Z1H5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms