Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kif28pD3YXS5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kif28pD3YXS5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kif28pD3YXS5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kif28pD3YXS5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kif28pD3YXS5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kif28pD3YXS5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kif28pD3YXS5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kif28pD3YXS5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kif28pD3YXS5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kif28pD3YXS5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kif28pD3YXS5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kif28pD3YXS5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kif28pD3YXS5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kif28pD3YXS5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kif28pD3YXS5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kif28pD3YXS5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kif28pD3YXS5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Kif28pD3YXS5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kif28pD3YXS5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kif28pD3YXS5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kif28pD3YXS5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kif28pD3YXS5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kif28pD3YXS5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kif28pD3YXS5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kif28pD3YXS5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kif28pD3YXS5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kif28pD3YXS5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kif28pD3YXS5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kif28pD3YXS5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kif28pD3YXS5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kif28pD3YXS5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Kif28pD3YXS5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kif28pD3YXS5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kif28pD3YXS5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kif28pD3YXS5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kif28pD3YXS5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kif28pD3YXS5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Kif28pD3YXS5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Kif28pD3YXS5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kif28pD3YXS5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kif28pD3YXS5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kif28pD3YXS5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kif28pD3YXS5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kif28pD3YXS5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kif28pD3YXS5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kif28pD3YXS5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Kif28pD3YXS5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kif28pD3YXS5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kif28pD3YXS5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kif28pD3YXS5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kif28pD3YXS5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kif28pD3YXS5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kif28pD3YXS5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kif28pD3YXS5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kif28pD3YXS5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Kif28pD3YXS5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kif28pD3YXS5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Kif28pD3YXS5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kif28pD3YXS5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kif28pD3YXS5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kif28pD3YXS5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kif28pD3YXS5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kif28pD3YXS5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kif28pD3YXS5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kif28pD3YXS5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kif28pD3YXS5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Kif28pD3YXS5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Kif28pD3YXS5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kif28pD3YXS5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kif28pD3YXS5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kif28pD3YXS5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kif28pD3YXS5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kif28pD3YXS5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kif28pD3YXS5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kif28pD3YXS5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kif28pD3YXS5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kif28pD3YXS5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kif28pD3YXS5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kif28pD3YXS5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kif28pD3YXS5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kif28pD3YXS5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Kif28pD3YXS5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kif28pD3YXS5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kif28pD3YXS5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kif28pD3YXS5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kif28pD3YXS5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Kif28pD3YXS5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kif28pD3YXS5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kif28pD3YXS5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kif28pD3YXS5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kif28pD3YXS5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kif28pD3YXS5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kif28pD3YXS5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kif28pD3YXS5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kif28pD3YXS5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kif28pD3YXS5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kif28pD3YXS5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kif28pD3YXS5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kif28pD3YXS5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms