Protein–RNA interactions for Protein: D3YWB7

Gm4297, Predicted gene 4297, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4297D3YWB7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm4297D3YWB7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm4297D3YWB7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm4297D3YWB7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm4297D3YWB7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm4297D3YWB7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm4297D3YWB7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm4297D3YWB7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm4297D3YWB7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm4297D3YWB7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm4297D3YWB7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm4297D3YWB7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm4297D3YWB7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm4297D3YWB7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm4297D3YWB7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm4297D3YWB7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm4297D3YWB7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm4297D3YWB7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm4297D3YWB7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gm4297D3YWB7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm4297D3YWB7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm4297D3YWB7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm4297D3YWB7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm4297D3YWB7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm4297D3YWB7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm4297D3YWB7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm4297D3YWB7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm4297D3YWB7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm4297D3YWB7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm4297D3YWB7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm4297D3YWB7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm4297D3YWB7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm4297D3YWB7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm4297D3YWB7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm4297D3YWB7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm4297D3YWB7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm4297D3YWB7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm4297D3YWB7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm4297D3YWB7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm4297D3YWB7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm4297D3YWB7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm4297D3YWB7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm4297D3YWB7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm4297D3YWB7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm4297D3YWB7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm4297D3YWB7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm4297D3YWB7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm4297D3YWB7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm4297D3YWB7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm4297D3YWB7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm4297D3YWB7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm4297D3YWB7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm4297D3YWB7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm4297D3YWB7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm4297D3YWB7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm4297D3YWB7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm4297D3YWB7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm4297D3YWB7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm4297D3YWB7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm4297D3YWB7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm4297D3YWB7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gm4297D3YWB7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm4297D3YWB7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm4297D3YWB7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm4297D3YWB7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm4297D3YWB7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm4297D3YWB7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm4297D3YWB7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm4297D3YWB7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm4297D3YWB7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm4297D3YWB7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm4297D3YWB7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm4297D3YWB7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm4297D3YWB7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm4297D3YWB7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm4297D3YWB7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm4297D3YWB7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm4297D3YWB7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm4297D3YWB7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm4297D3YWB7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm4297D3YWB7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm4297D3YWB7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm4297D3YWB7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm4297D3YWB7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm4297D3YWB7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm4297D3YWB7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm4297D3YWB7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm4297D3YWB7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm4297D3YWB7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm4297D3YWB7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm4297D3YWB7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm4297D3YWB7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm4297D3YWB7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm4297D3YWB7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm4297D3YWB7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm4297D3YWB7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm4297D3YWB7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm4297D3YWB7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm4297D3YWB7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm4297D3YWB7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms