Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim30cD3YVI9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim30cD3YVI9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim30cD3YVI9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim30cD3YVI9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim30cD3YVI9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim30cD3YVI9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim30cD3YVI9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim30cD3YVI9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim30cD3YVI9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim30cD3YVI9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim30cD3YVI9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim30cD3YVI9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim30cD3YVI9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim30cD3YVI9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim30cD3YVI9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim30cD3YVI9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim30cD3YVI9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim30cD3YVI9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim30cD3YVI9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim30cD3YVI9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim30cD3YVI9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim30cD3YVI9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim30cD3YVI9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim30cD3YVI9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim30cD3YVI9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim30cD3YVI9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim30cD3YVI9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim30cD3YVI9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim30cD3YVI9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trim30cD3YVI9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim30cD3YVI9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim30cD3YVI9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim30cD3YVI9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim30cD3YVI9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim30cD3YVI9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim30cD3YVI9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim30cD3YVI9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim30cD3YVI9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim30cD3YVI9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim30cD3YVI9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim30cD3YVI9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim30cD3YVI9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim30cD3YVI9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim30cD3YVI9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim30cD3YVI9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim30cD3YVI9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trim30cD3YVI9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trim30cD3YVI9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim30cD3YVI9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim30cD3YVI9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim30cD3YVI9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim30cD3YVI9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim30cD3YVI9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim30cD3YVI9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim30cD3YVI9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim30cD3YVI9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim30cD3YVI9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim30cD3YVI9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim30cD3YVI9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim30cD3YVI9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim30cD3YVI9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim30cD3YVI9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim30cD3YVI9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim30cD3YVI9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim30cD3YVI9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim30cD3YVI9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim30cD3YVI9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim30cD3YVI9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim30cD3YVI9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim30cD3YVI9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim30cD3YVI9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim30cD3YVI9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim30cD3YVI9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim30cD3YVI9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim30cD3YVI9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim30cD3YVI9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim30cD3YVI9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim30cD3YVI9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim30cD3YVI9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim30cD3YVI9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim30cD3YVI9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim30cD3YVI9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim30cD3YVI9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim30cD3YVI9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim30cD3YVI9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim30cD3YVI9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim30cD3YVI9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim30cD3YVI9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim30cD3YVI9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim30cD3YVI9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim30cD3YVI9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim30cD3YVI9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim30cD3YVI9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim30cD3YVI9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim30cD3YVI9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim30cD3YVI9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim30cD3YVI9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim30cD3YVI9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim30cD3YVI9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms