Protein–RNA interactions for Protein: D3YUR1

4930444P10Rik, RIKEN cDNA 4930444P10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444P10RikD3YUR1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
4930444P10RikD3YUR1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930444P10RikD3YUR1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930444P10RikD3YUR1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930444P10RikD3YUR1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930444P10RikD3YUR1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930444P10RikD3YUR1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930444P10RikD3YUR1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930444P10RikD3YUR1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930444P10RikD3YUR1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930444P10RikD3YUR1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930444P10RikD3YUR1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930444P10RikD3YUR1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930444P10RikD3YUR1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930444P10RikD3YUR1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930444P10RikD3YUR1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930444P10RikD3YUR1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930444P10RikD3YUR1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930444P10RikD3YUR1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930444P10RikD3YUR1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930444P10RikD3YUR1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930444P10RikD3YUR1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930444P10RikD3YUR1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930444P10RikD3YUR1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930444P10RikD3YUR1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930444P10RikD3YUR1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930444P10RikD3YUR1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
4930444P10RikD3YUR1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930444P10RikD3YUR1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930444P10RikD3YUR1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930444P10RikD3YUR1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930444P10RikD3YUR1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930444P10RikD3YUR1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
4930444P10RikD3YUR1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930444P10RikD3YUR1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930444P10RikD3YUR1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930444P10RikD3YUR1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930444P10RikD3YUR1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930444P10RikD3YUR1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930444P10RikD3YUR1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930444P10RikD3YUR1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930444P10RikD3YUR1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930444P10RikD3YUR1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930444P10RikD3YUR1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930444P10RikD3YUR1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930444P10RikD3YUR1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930444P10RikD3YUR1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930444P10RikD3YUR1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930444P10RikD3YUR1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930444P10RikD3YUR1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930444P10RikD3YUR1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930444P10RikD3YUR1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930444P10RikD3YUR1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930444P10RikD3YUR1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930444P10RikD3YUR1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930444P10RikD3YUR1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
4930444P10RikD3YUR1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930444P10RikD3YUR1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
4930444P10RikD3YUR1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930444P10RikD3YUR1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930444P10RikD3YUR1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930444P10RikD3YUR1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930444P10RikD3YUR1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930444P10RikD3YUR1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930444P10RikD3YUR1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930444P10RikD3YUR1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930444P10RikD3YUR1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930444P10RikD3YUR1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930444P10RikD3YUR1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930444P10RikD3YUR1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
4930444P10RikD3YUR1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930444P10RikD3YUR1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930444P10RikD3YUR1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930444P10RikD3YUR1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930444P10RikD3YUR1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930444P10RikD3YUR1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930444P10RikD3YUR1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930444P10RikD3YUR1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930444P10RikD3YUR1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930444P10RikD3YUR1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930444P10RikD3YUR1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930444P10RikD3YUR1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930444P10RikD3YUR1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930444P10RikD3YUR1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930444P10RikD3YUR1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930444P10RikD3YUR1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930444P10RikD3YUR1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930444P10RikD3YUR1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930444P10RikD3YUR1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930444P10RikD3YUR1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930444P10RikD3YUR1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
4930444P10RikD3YUR1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930444P10RikD3YUR1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930444P10RikD3YUR1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930444P10RikD3YUR1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930444P10RikD3YUR1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
4930444P10RikD3YUR1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930444P10RikD3YUR1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930444P10RikD3YUR1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930444P10RikD3YUR1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms