Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK8

1700015F17Rik, RIKEN cDNA 1700015F17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700015F17RikD3YUK8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700015F17RikD3YUK8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700015F17RikD3YUK8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
1700015F17RikD3YUK8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
1700015F17RikD3YUK8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
1700015F17RikD3YUK8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
1700015F17RikD3YUK8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700015F17RikD3YUK8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700015F17RikD3YUK8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700015F17RikD3YUK8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700015F17RikD3YUK8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700015F17RikD3YUK8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700015F17RikD3YUK8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700015F17RikD3YUK8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700015F17RikD3YUK8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700015F17RikD3YUK8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700015F17RikD3YUK8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700015F17RikD3YUK8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700015F17RikD3YUK8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700015F17RikD3YUK8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700015F17RikD3YUK8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700015F17RikD3YUK8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700015F17RikD3YUK8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700015F17RikD3YUK8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700015F17RikD3YUK8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700015F17RikD3YUK8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700015F17RikD3YUK8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700015F17RikD3YUK8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700015F17RikD3YUK8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700015F17RikD3YUK8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700015F17RikD3YUK8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
1700015F17RikD3YUK8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700015F17RikD3YUK8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700015F17RikD3YUK8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700015F17RikD3YUK8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700015F17RikD3YUK8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700015F17RikD3YUK8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700015F17RikD3YUK8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700015F17RikD3YUK8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700015F17RikD3YUK8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700015F17RikD3YUK8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700015F17RikD3YUK8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700015F17RikD3YUK8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700015F17RikD3YUK8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700015F17RikD3YUK8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700015F17RikD3YUK8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700015F17RikD3YUK8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700015F17RikD3YUK8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
1700015F17RikD3YUK8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700015F17RikD3YUK8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700015F17RikD3YUK8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700015F17RikD3YUK8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700015F17RikD3YUK8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700015F17RikD3YUK8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700015F17RikD3YUK8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700015F17RikD3YUK8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700015F17RikD3YUK8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700015F17RikD3YUK8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700015F17RikD3YUK8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700015F17RikD3YUK8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700015F17RikD3YUK8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700015F17RikD3YUK8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700015F17RikD3YUK8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700015F17RikD3YUK8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700015F17RikD3YUK8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700015F17RikD3YUK8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700015F17RikD3YUK8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700015F17RikD3YUK8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700015F17RikD3YUK8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700015F17RikD3YUK8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700015F17RikD3YUK8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
1700015F17RikD3YUK8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700015F17RikD3YUK8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700015F17RikD3YUK8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700015F17RikD3YUK8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700015F17RikD3YUK8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700015F17RikD3YUK8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700015F17RikD3YUK8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700015F17RikD3YUK8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700015F17RikD3YUK8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700015F17RikD3YUK8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700015F17RikD3YUK8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700015F17RikD3YUK8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700015F17RikD3YUK8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700015F17RikD3YUK8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700015F17RikD3YUK8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700015F17RikD3YUK8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700015F17RikD3YUK8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700015F17RikD3YUK8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700015F17RikD3YUK8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700015F17RikD3YUK8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700015F17RikD3YUK8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700015F17RikD3YUK8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700015F17RikD3YUK8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700015F17RikD3YUK8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700015F17RikD3YUK8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700015F17RikD3YUK8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700015F17RikD3YUK8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700015F17RikD3YUK8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700015F17RikD3YUK8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms