Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2d4D3YUH6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2d4D3YUH6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2d4D3YUH6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2d4D3YUH6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2d4D3YUH6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2d4D3YUH6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2d4D3YUH6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2d4D3YUH6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2d4D3YUH6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2d4D3YUH6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2d4D3YUH6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2d4D3YUH6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d4D3YUH6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d4D3YUH6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d4D3YUH6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d4D3YUH6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d4D3YUH6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d4D3YUH6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d4D3YUH6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d4D3YUH6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d4D3YUH6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d4D3YUH6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2d4D3YUH6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2d4D3YUH6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2d4D3YUH6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2d4D3YUH6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2d4D3YUH6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2d4D3YUH6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2d4D3YUH6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2d4D3YUH6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2d4D3YUH6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2d4D3YUH6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2d4D3YUH6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2d4D3YUH6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2d4D3YUH6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2d4D3YUH6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2d4D3YUH6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2d4D3YUH6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2d4D3YUH6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2d4D3YUH6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2d4D3YUH6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2d4D3YUH6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2d4D3YUH6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2d4D3YUH6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2d4D3YUH6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2d4D3YUH6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2d4D3YUH6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2d4D3YUH6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2d4D3YUH6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2d4D3YUH6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2d4D3YUH6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2d4D3YUH6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2d4D3YUH6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2d4D3YUH6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2d4D3YUH6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2d4D3YUH6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2d4D3YUH6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2d4D3YUH6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2d4D3YUH6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2d4D3YUH6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2d4D3YUH6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2d4D3YUH6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2d4D3YUH6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2d4D3YUH6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2d4D3YUH6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2d4D3YUH6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2d4D3YUH6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2d4D3YUH6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2d4D3YUH6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2d4D3YUH6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2d4D3YUH6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2d4D3YUH6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2d4D3YUH6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2d4D3YUH6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2d4D3YUH6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2d4D3YUH6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2d4D3YUH6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2d4D3YUH6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2d4D3YUH6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2d4D3YUH6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2d4D3YUH6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2d4D3YUH6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2d4D3YUH6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2d4D3YUH6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2d4D3YUH6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2d4D3YUH6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2d4D3YUH6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2d4D3YUH6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2d4D3YUH6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2d4D3YUH6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2d4D3YUH6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2d4D3YUH6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2d4D3YUH6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2d4D3YUH6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube2d4D3YUH6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube2d4D3YUH6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2d4D3YUH6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2d4D3YUH6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2d4D3YUH6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms