Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trappc11B2RXC1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trappc11B2RXC1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trappc11B2RXC1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trappc11B2RXC1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trappc11B2RXC1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Trappc11B2RXC1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trappc11B2RXC1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Trappc11B2RXC1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Trappc11B2RXC1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trappc11B2RXC1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trappc11B2RXC1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trappc11B2RXC1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trappc11B2RXC1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trappc11B2RXC1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trappc11B2RXC1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trappc11B2RXC1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trappc11B2RXC1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trappc11B2RXC1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trappc11B2RXC1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trappc11B2RXC1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trappc11B2RXC1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trappc11B2RXC1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trappc11B2RXC1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trappc11B2RXC1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trappc11B2RXC1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trappc11B2RXC1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trappc11B2RXC1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trappc11B2RXC1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trappc11B2RXC1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trappc11B2RXC1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trappc11B2RXC1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trappc11B2RXC1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trappc11B2RXC1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trappc11B2RXC1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trappc11B2RXC1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trappc11B2RXC1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trappc11B2RXC1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trappc11B2RXC1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trappc11B2RXC1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trappc11B2RXC1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trappc11B2RXC1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trappc11B2RXC1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trappc11B2RXC1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trappc11B2RXC1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trappc11B2RXC1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trappc11B2RXC1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Trappc11B2RXC1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Trappc11B2RXC1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Trappc11B2RXC1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Trappc11B2RXC1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trappc11B2RXC1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trappc11B2RXC1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trappc11B2RXC1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trappc11B2RXC1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trappc11B2RXC1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trappc11B2RXC1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trappc11B2RXC1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trappc11B2RXC1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trappc11B2RXC1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trappc11B2RXC1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trappc11B2RXC1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trappc11B2RXC1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trappc11B2RXC1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trappc11B2RXC1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trappc11B2RXC1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trappc11B2RXC1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trappc11B2RXC1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trappc11B2RXC1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trappc11B2RXC1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trappc11B2RXC1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trappc11B2RXC1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trappc11B2RXC1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trappc11B2RXC1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trappc11B2RXC1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trappc11B2RXC1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trappc11B2RXC1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trappc11B2RXC1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trappc11B2RXC1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Trappc11B2RXC1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trappc11B2RXC1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trappc11B2RXC1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trappc11B2RXC1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trappc11B2RXC1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Trappc11B2RXC1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trappc11B2RXC1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trappc11B2RXC1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trappc11B2RXC1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trappc11B2RXC1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trappc11B2RXC1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trappc11B2RXC1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trappc11B2RXC1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trappc11B2RXC1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trappc11B2RXC1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trappc11B2RXC1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trappc11B2RXC1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Trappc11B2RXC1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trappc11B2RXC1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trappc11B2RXC1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trappc11B2RXC1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms