Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Otud7bB2RUR8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Otud7bB2RUR8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Otud7bB2RUR8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Otud7bB2RUR8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Otud7bB2RUR8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Otud7bB2RUR8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Otud7bB2RUR8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Otud7bB2RUR8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Otud7bB2RUR8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Otud7bB2RUR8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Otud7bB2RUR8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Otud7bB2RUR8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Otud7bB2RUR8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Otud7bB2RUR8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Otud7bB2RUR8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Otud7bB2RUR8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Otud7bB2RUR8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Otud7bB2RUR8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Otud7bB2RUR8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Otud7bB2RUR8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Otud7bB2RUR8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Otud7bB2RUR8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Otud7bB2RUR8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Otud7bB2RUR8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Otud7bB2RUR8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Otud7bB2RUR8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Otud7bB2RUR8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Otud7bB2RUR8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Otud7bB2RUR8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Otud7bB2RUR8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Otud7bB2RUR8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Otud7bB2RUR8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Otud7bB2RUR8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Otud7bB2RUR8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Otud7bB2RUR8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Otud7bB2RUR8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Otud7bB2RUR8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Otud7bB2RUR8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Otud7bB2RUR8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Otud7bB2RUR8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Otud7bB2RUR8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Otud7bB2RUR8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Otud7bB2RUR8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Otud7bB2RUR8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Otud7bB2RUR8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Otud7bB2RUR8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Otud7bB2RUR8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Otud7bB2RUR8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Otud7bB2RUR8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Otud7bB2RUR8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Otud7bB2RUR8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Otud7bB2RUR8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Otud7bB2RUR8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Otud7bB2RUR8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Otud7bB2RUR8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Otud7bB2RUR8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Otud7bB2RUR8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Otud7bB2RUR8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Otud7bB2RUR8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Otud7bB2RUR8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Otud7bB2RUR8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Otud7bB2RUR8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Otud7bB2RUR8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Otud7bB2RUR8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Otud7bB2RUR8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Otud7bB2RUR8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Otud7bB2RUR8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Otud7bB2RUR8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Otud7bB2RUR8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Otud7bB2RUR8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Otud7bB2RUR8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Otud7bB2RUR8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Otud7bB2RUR8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Otud7bB2RUR8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Otud7bB2RUR8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Otud7bB2RUR8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Otud7bB2RUR8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Otud7bB2RUR8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Otud7bB2RUR8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Otud7bB2RUR8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Otud7bB2RUR8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Otud7bB2RUR8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Otud7bB2RUR8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Otud7bB2RUR8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Otud7bB2RUR8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Otud7bB2RUR8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Otud7bB2RUR8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Otud7bB2RUR8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Otud7bB2RUR8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Otud7bB2RUR8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Otud7bB2RUR8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Otud7bB2RUR8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Otud7bB2RUR8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Otud7bB2RUR8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Otud7bB2RUR8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Otud7bB2RUR8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Otud7bB2RUR8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Otud7bB2RUR8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Otud7bB2RUR8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms