Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rrn3B2RS91 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rrn3B2RS91 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rrn3B2RS91 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rrn3B2RS91 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rrn3B2RS91 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rrn3B2RS91 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rrn3B2RS91 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rrn3B2RS91 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rrn3B2RS91 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rrn3B2RS91 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rrn3B2RS91 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rrn3B2RS91 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rrn3B2RS91 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rrn3B2RS91 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rrn3B2RS91 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rrn3B2RS91 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rrn3B2RS91 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rrn3B2RS91 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rrn3B2RS91 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rrn3B2RS91 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rrn3B2RS91 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rrn3B2RS91 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rrn3B2RS91 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrn3B2RS91 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrn3B2RS91 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rrn3B2RS91 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rrn3B2RS91 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rrn3B2RS91 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rrn3B2RS91 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rrn3B2RS91 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rrn3B2RS91 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rrn3B2RS91 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rrn3B2RS91 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rrn3B2RS91 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rrn3B2RS91 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rrn3B2RS91 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rrn3B2RS91 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rrn3B2RS91 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rrn3B2RS91 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rrn3B2RS91 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rrn3B2RS91 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rrn3B2RS91 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rrn3B2RS91 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rrn3B2RS91 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rrn3B2RS91 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rrn3B2RS91 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rrn3B2RS91 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrn3B2RS91 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrn3B2RS91 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrn3B2RS91 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rrn3B2RS91 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rrn3B2RS91 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrn3B2RS91 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rrn3B2RS91 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rrn3B2RS91 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrn3B2RS91 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrn3B2RS91 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrn3B2RS91 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrn3B2RS91 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrn3B2RS91 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrn3B2RS91 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrn3B2RS91 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrn3B2RS91 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrn3B2RS91 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrn3B2RS91 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrn3B2RS91 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrn3B2RS91 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrn3B2RS91 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrn3B2RS91 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrn3B2RS91 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrn3B2RS91 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrn3B2RS91 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrn3B2RS91 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrn3B2RS91 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrn3B2RS91 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrn3B2RS91 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrn3B2RS91 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrn3B2RS91 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrn3B2RS91 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrn3B2RS91 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrn3B2RS91 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Rrn3B2RS91 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rrn3B2RS91 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rrn3B2RS91 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rrn3B2RS91 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rrn3B2RS91 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rrn3B2RS91 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rrn3B2RS91 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rrn3B2RS91 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rrn3B2RS91 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rrn3B2RS91 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rrn3B2RS91 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rrn3B2RS91 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rrn3B2RS91 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rrn3B2RS91 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rrn3B2RS91 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rrn3B2RS91 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rrn3B2RS91 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rrn3B2RS91 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
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