Protein–RNA interactions for Protein: B2RQY6

BC035947, BC035947 protein, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035947B2RQY6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BC035947B2RQY6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BC035947B2RQY6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BC035947B2RQY6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BC035947B2RQY6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BC035947B2RQY6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BC035947B2RQY6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BC035947B2RQY6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BC035947B2RQY6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BC035947B2RQY6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BC035947B2RQY6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BC035947B2RQY6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BC035947B2RQY6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BC035947B2RQY6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BC035947B2RQY6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BC035947B2RQY6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BC035947B2RQY6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BC035947B2RQY6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BC035947B2RQY6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BC035947B2RQY6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BC035947B2RQY6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BC035947B2RQY6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BC035947B2RQY6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BC035947B2RQY6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BC035947B2RQY6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BC035947B2RQY6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BC035947B2RQY6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BC035947B2RQY6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BC035947B2RQY6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BC035947B2RQY6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BC035947B2RQY6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BC035947B2RQY6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BC035947B2RQY6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BC035947B2RQY6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BC035947B2RQY6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BC035947B2RQY6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BC035947B2RQY6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BC035947B2RQY6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BC035947B2RQY6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BC035947B2RQY6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BC035947B2RQY6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BC035947B2RQY6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BC035947B2RQY6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BC035947B2RQY6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BC035947B2RQY6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BC035947B2RQY6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BC035947B2RQY6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BC035947B2RQY6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BC035947B2RQY6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BC035947B2RQY6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BC035947B2RQY6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BC035947B2RQY6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BC035947B2RQY6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BC035947B2RQY6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BC035947B2RQY6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BC035947B2RQY6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BC035947B2RQY6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BC035947B2RQY6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BC035947B2RQY6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BC035947B2RQY6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BC035947B2RQY6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BC035947B2RQY6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BC035947B2RQY6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BC035947B2RQY6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BC035947B2RQY6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BC035947B2RQY6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BC035947B2RQY6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BC035947B2RQY6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BC035947B2RQY6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BC035947B2RQY6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BC035947B2RQY6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BC035947B2RQY6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BC035947B2RQY6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BC035947B2RQY6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BC035947B2RQY6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BC035947B2RQY6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BC035947B2RQY6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BC035947B2RQY6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BC035947B2RQY6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BC035947B2RQY6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BC035947B2RQY6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BC035947B2RQY6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BC035947B2RQY6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BC035947B2RQY6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BC035947B2RQY6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BC035947B2RQY6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BC035947B2RQY6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BC035947B2RQY6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BC035947B2RQY6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BC035947B2RQY6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BC035947B2RQY6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BC035947B2RQY6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BC035947B2RQY6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BC035947B2RQY6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BC035947B2RQY6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BC035947B2RQY6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BC035947B2RQY6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BC035947B2RQY6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BC035947B2RQY6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BC035947B2RQY6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms