Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Uhrf1bp1B2KF50 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Uhrf1bp1B2KF50 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Uhrf1bp1B2KF50 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Uhrf1bp1B2KF50 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Uhrf1bp1B2KF50 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Uhrf1bp1B2KF50 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Uhrf1bp1B2KF50 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Uhrf1bp1B2KF50 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Uhrf1bp1B2KF50 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Uhrf1bp1B2KF50 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Uhrf1bp1B2KF50 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Uhrf1bp1B2KF50 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Uhrf1bp1B2KF50 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Uhrf1bp1B2KF50 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Uhrf1bp1B2KF50 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Uhrf1bp1B2KF50 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Uhrf1bp1B2KF50 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Uhrf1bp1B2KF50 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Uhrf1bp1B2KF50 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Uhrf1bp1B2KF50 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Uhrf1bp1B2KF50 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Uhrf1bp1B2KF50 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Uhrf1bp1B2KF50 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Uhrf1bp1B2KF50 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Uhrf1bp1B2KF50 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Uhrf1bp1B2KF50 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Uhrf1bp1B2KF50 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Uhrf1bp1B2KF50 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Uhrf1bp1B2KF50 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Uhrf1bp1B2KF50 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Uhrf1bp1B2KF50 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Uhrf1bp1B2KF50 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Uhrf1bp1B2KF50 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Uhrf1bp1B2KF50 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Uhrf1bp1B2KF50 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Uhrf1bp1B2KF50 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Uhrf1bp1B2KF50 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Uhrf1bp1B2KF50 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Uhrf1bp1B2KF50 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Uhrf1bp1B2KF50 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Uhrf1bp1B2KF50 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Uhrf1bp1B2KF50 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Uhrf1bp1B2KF50 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Uhrf1bp1B2KF50 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Uhrf1bp1B2KF50 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Uhrf1bp1B2KF50 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Uhrf1bp1B2KF50 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Uhrf1bp1B2KF50 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Uhrf1bp1B2KF50 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Uhrf1bp1B2KF50 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Uhrf1bp1B2KF50 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Uhrf1bp1B2KF50 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Uhrf1bp1B2KF50 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Uhrf1bp1B2KF50 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Uhrf1bp1B2KF50 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Uhrf1bp1B2KF50 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Uhrf1bp1B2KF50 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Uhrf1bp1B2KF50 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Uhrf1bp1B2KF50 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Uhrf1bp1B2KF50 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Uhrf1bp1B2KF50 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Uhrf1bp1B2KF50 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Uhrf1bp1B2KF50 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Uhrf1bp1B2KF50 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Uhrf1bp1B2KF50 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Uhrf1bp1B2KF50 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Uhrf1bp1B2KF50 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Uhrf1bp1B2KF50 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Uhrf1bp1B2KF50 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Uhrf1bp1B2KF50 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Uhrf1bp1B2KF50 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Uhrf1bp1B2KF50 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Uhrf1bp1B2KF50 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Uhrf1bp1B2KF50 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Uhrf1bp1B2KF50 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Uhrf1bp1B2KF50 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Uhrf1bp1B2KF50 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
Uhrf1bp1B2KF50 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Uhrf1bp1B2KF50 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Uhrf1bp1B2KF50 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Uhrf1bp1B2KF50 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Uhrf1bp1B2KF50 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Uhrf1bp1B2KF50 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Uhrf1bp1B2KF50 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Uhrf1bp1B2KF50 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Uhrf1bp1B2KF50 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms