Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Prr29B1ARI9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Prr29B1ARI9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Prr29B1ARI9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Prr29B1ARI9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Prr29B1ARI9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Prr29B1ARI9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Prr29B1ARI9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Prr29B1ARI9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Prr29B1ARI9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Prr29B1ARI9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Prr29B1ARI9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Prr29B1ARI9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Prr29B1ARI9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Prr29B1ARI9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Prr29B1ARI9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Prr29B1ARI9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Prr29B1ARI9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Prr29B1ARI9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Prr29B1ARI9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Prr29B1ARI9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Prr29B1ARI9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Prr29B1ARI9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Prr29B1ARI9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Prr29B1ARI9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Prr29B1ARI9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Prr29B1ARI9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Prr29B1ARI9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Prr29B1ARI9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Prr29B1ARI9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Prr29B1ARI9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Prr29B1ARI9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Prr29B1ARI9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Prr29B1ARI9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Prr29B1ARI9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Prr29B1ARI9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Prr29B1ARI9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Prr29B1ARI9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Prr29B1ARI9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Prr29B1ARI9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Prr29B1ARI9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Prr29B1ARI9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Prr29B1ARI9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Prr29B1ARI9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Prr29B1ARI9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Prr29B1ARI9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Prr29B1ARI9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Prr29B1ARI9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Prr29B1ARI9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Prr29B1ARI9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Prr29B1ARI9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Prr29B1ARI9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Prr29B1ARI9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Prr29B1ARI9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Prr29B1ARI9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Prr29B1ARI9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Prr29B1ARI9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Prr29B1ARI9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Prr29B1ARI9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Prr29B1ARI9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Prr29B1ARI9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Prr29B1ARI9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Prr29B1ARI9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Prr29B1ARI9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Prr29B1ARI9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Prr29B1ARI9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Prr29B1ARI9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Prr29B1ARI9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Prr29B1ARI9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Prr29B1ARI9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Prr29B1ARI9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Prr29B1ARI9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Prr29B1ARI9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Prr29B1ARI9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Prr29B1ARI9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Prr29B1ARI9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Prr29B1ARI9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Prr29B1ARI9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Prr29B1ARI9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Prr29B1ARI9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Prr29B1ARI9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Prr29B1ARI9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Prr29B1ARI9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Prr29B1ARI9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Prr29B1ARI9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Prr29B1ARI9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Prr29B1ARI9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Prr29B1ARI9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Prr29B1ARI9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Prr29B1ARI9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Prr29B1ARI9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Prr29B1ARI9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Prr29B1ARI9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Prr29B1ARI9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Prr29B1ARI9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Prr29B1ARI9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Prr29B1ARI9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Prr29B1ARI9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Prr29B1ARI9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Prr29B1ARI9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms