Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scn1aA2APX8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scn1aA2APX8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scn1aA2APX8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scn1aA2APX8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scn1aA2APX8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scn1aA2APX8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Scn1aA2APX8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scn1aA2APX8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Scn1aA2APX8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scn1aA2APX8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scn1aA2APX8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scn1aA2APX8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Scn1aA2APX8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Scn1aA2APX8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scn1aA2APX8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scn1aA2APX8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scn1aA2APX8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scn1aA2APX8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scn1aA2APX8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scn1aA2APX8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scn1aA2APX8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scn1aA2APX8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scn1aA2APX8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scn1aA2APX8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scn1aA2APX8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scn1aA2APX8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scn1aA2APX8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scn1aA2APX8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scn1aA2APX8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scn1aA2APX8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scn1aA2APX8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scn1aA2APX8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scn1aA2APX8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scn1aA2APX8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Scn1aA2APX8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scn1aA2APX8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scn1aA2APX8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scn1aA2APX8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Scn1aA2APX8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scn1aA2APX8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scn1aA2APX8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scn1aA2APX8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Scn1aA2APX8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Scn1aA2APX8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scn1aA2APX8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scn1aA2APX8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scn1aA2APX8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scn1aA2APX8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scn1aA2APX8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scn1aA2APX8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scn1aA2APX8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scn1aA2APX8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scn1aA2APX8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scn1aA2APX8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scn1aA2APX8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Scn1aA2APX8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Scn1aA2APX8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scn1aA2APX8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scn1aA2APX8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scn1aA2APX8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scn1aA2APX8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scn1aA2APX8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Scn1aA2APX8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Scn1aA2APX8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Scn1aA2APX8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scn1aA2APX8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scn1aA2APX8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scn1aA2APX8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Scn1aA2APX8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Scn1aA2APX8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scn1aA2APX8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Scn1aA2APX8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scn1aA2APX8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Scn1aA2APX8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scn1aA2APX8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scn1aA2APX8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Scn1aA2APX8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scn1aA2APX8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scn1aA2APX8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scn1aA2APX8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scn1aA2APX8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scn1aA2APX8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scn1aA2APX8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scn1aA2APX8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scn1aA2APX8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scn1aA2APX8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scn1aA2APX8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scn1aA2APX8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scn1aA2APX8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scn1aA2APX8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scn1aA2APX8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scn1aA2APX8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scn1aA2APX8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scn1aA2APX8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scn1aA2APX8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scn1aA2APX8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scn1aA2APX8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scn1aA2APX8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scn1aA2APX8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms