Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syndig1A2ANU3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syndig1A2ANU3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syndig1A2ANU3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Syndig1A2ANU3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syndig1A2ANU3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syndig1A2ANU3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Syndig1A2ANU3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Syndig1A2ANU3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23■■□□□ 1.27
Syndig1A2ANU3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Syndig1A2ANU3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Syndig1A2ANU3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Syndig1A2ANU3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Syndig1A2ANU3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Syndig1A2ANU3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syndig1A2ANU3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syndig1A2ANU3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Syndig1A2ANU3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syndig1A2ANU3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syndig1A2ANU3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syndig1A2ANU3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syndig1A2ANU3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syndig1A2ANU3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syndig1A2ANU3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syndig1A2ANU3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syndig1A2ANU3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Syndig1A2ANU3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Syndig1A2ANU3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syndig1A2ANU3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Syndig1A2ANU3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syndig1A2ANU3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syndig1A2ANU3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syndig1A2ANU3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Syndig1A2ANU3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syndig1A2ANU3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syndig1A2ANU3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syndig1A2ANU3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syndig1A2ANU3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syndig1A2ANU3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syndig1A2ANU3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syndig1A2ANU3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syndig1A2ANU3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syndig1A2ANU3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syndig1A2ANU3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syndig1A2ANU3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Syndig1A2ANU3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Syndig1A2ANU3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syndig1A2ANU3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syndig1A2ANU3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syndig1A2ANU3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syndig1A2ANU3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syndig1A2ANU3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syndig1A2ANU3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syndig1A2ANU3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syndig1A2ANU3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syndig1A2ANU3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syndig1A2ANU3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syndig1A2ANU3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syndig1A2ANU3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syndig1A2ANU3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syndig1A2ANU3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syndig1A2ANU3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syndig1A2ANU3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Syndig1A2ANU3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Syndig1A2ANU3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Syndig1A2ANU3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Syndig1A2ANU3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syndig1A2ANU3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syndig1A2ANU3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syndig1A2ANU3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syndig1A2ANU3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syndig1A2ANU3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syndig1A2ANU3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syndig1A2ANU3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syndig1A2ANU3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syndig1A2ANU3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syndig1A2ANU3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syndig1A2ANU3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syndig1A2ANU3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syndig1A2ANU3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syndig1A2ANU3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syndig1A2ANU3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syndig1A2ANU3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Syndig1A2ANU3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syndig1A2ANU3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syndig1A2ANU3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syndig1A2ANU3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syndig1A2ANU3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syndig1A2ANU3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syndig1A2ANU3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syndig1A2ANU3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syndig1A2ANU3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syndig1A2ANU3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syndig1A2ANU3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syndig1A2ANU3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syndig1A2ANU3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syndig1A2ANU3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syndig1A2ANU3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syndig1A2ANU3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syndig1A2ANU3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms