Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pramel3A2AHA7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pramel3A2AHA7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pramel3A2AHA7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pramel3A2AHA7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pramel3A2AHA7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Pramel3A2AHA7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pramel3A2AHA7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pramel3A2AHA7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pramel3A2AHA7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Pramel3A2AHA7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pramel3A2AHA7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pramel3A2AHA7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pramel3A2AHA7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pramel3A2AHA7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pramel3A2AHA7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pramel3A2AHA7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pramel3A2AHA7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pramel3A2AHA7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pramel3A2AHA7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Pramel3A2AHA7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pramel3A2AHA7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pramel3A2AHA7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pramel3A2AHA7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pramel3A2AHA7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pramel3A2AHA7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pramel3A2AHA7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pramel3A2AHA7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pramel3A2AHA7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pramel3A2AHA7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pramel3A2AHA7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pramel3A2AHA7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pramel3A2AHA7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pramel3A2AHA7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pramel3A2AHA7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pramel3A2AHA7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Pramel3A2AHA7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pramel3A2AHA7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pramel3A2AHA7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pramel3A2AHA7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pramel3A2AHA7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pramel3A2AHA7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pramel3A2AHA7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pramel3A2AHA7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pramel3A2AHA7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pramel3A2AHA7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pramel3A2AHA7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pramel3A2AHA7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pramel3A2AHA7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pramel3A2AHA7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pramel3A2AHA7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pramel3A2AHA7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pramel3A2AHA7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pramel3A2AHA7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pramel3A2AHA7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pramel3A2AHA7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pramel3A2AHA7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pramel3A2AHA7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pramel3A2AHA7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pramel3A2AHA7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pramel3A2AHA7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pramel3A2AHA7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pramel3A2AHA7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pramel3A2AHA7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pramel3A2AHA7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pramel3A2AHA7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pramel3A2AHA7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pramel3A2AHA7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pramel3A2AHA7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pramel3A2AHA7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pramel3A2AHA7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pramel3A2AHA7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pramel3A2AHA7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pramel3A2AHA7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pramel3A2AHA7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pramel3A2AHA7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pramel3A2AHA7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pramel3A2AHA7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Pramel3A2AHA7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pramel3A2AHA7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pramel3A2AHA7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pramel3A2AHA7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pramel3A2AHA7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pramel3A2AHA7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pramel3A2AHA7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pramel3A2AHA7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pramel3A2AHA7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pramel3A2AHA7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pramel3A2AHA7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pramel3A2AHA7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pramel3A2AHA7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pramel3A2AHA7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pramel3A2AHA7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pramel3A2AHA7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pramel3A2AHA7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pramel3A2AHA7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pramel3A2AHA7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pramel3A2AHA7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pramel3A2AHA7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pramel3A2AHA7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms