Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Ambra1A2AH22 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ambra1A2AH22 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ambra1A2AH22 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.24
Ambra1A2AH22 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ambra1A2AH22 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ambra1A2AH22 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ambra1A2AH22 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ambra1A2AH22 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Ambra1A2AH22 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ambra1A2AH22 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ambra1A2AH22 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ambra1A2AH22 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ambra1A2AH22 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ambra1A2AH22 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ambra1A2AH22 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Ambra1A2AH22 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ambra1A2AH22 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Ambra1A2AH22 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Ambra1A2AH22 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ambra1A2AH22 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ambra1A2AH22 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Ambra1A2AH22 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Ambra1A2AH22 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ambra1A2AH22 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ambra1A2AH22 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ambra1A2AH22 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ambra1A2AH22 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ambra1A2AH22 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Ambra1A2AH22 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ambra1A2AH22 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ambra1A2AH22 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Ambra1A2AH22 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ambra1A2AH22 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ambra1A2AH22 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ambra1A2AH22 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ambra1A2AH22 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ambra1A2AH22 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ambra1A2AH22 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ambra1A2AH22 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ambra1A2AH22 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ambra1A2AH22 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ambra1A2AH22 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ambra1A2AH22 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Ambra1A2AH22 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ambra1A2AH22 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ambra1A2AH22 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ambra1A2AH22 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Ambra1A2AH22 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ambra1A2AH22 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ambra1A2AH22 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ambra1A2AH22 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ambra1A2AH22 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ambra1A2AH22 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ambra1A2AH22 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ambra1A2AH22 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Ambra1A2AH22 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ambra1A2AH22 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ambra1A2AH22 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ambra1A2AH22 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ambra1A2AH22 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ambra1A2AH22 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ambra1A2AH22 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Ambra1A2AH22 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ambra1A2AH22 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ambra1A2AH22 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ambra1A2AH22 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ambra1A2AH22 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ambra1A2AH22 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ambra1A2AH22 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ambra1A2AH22 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ambra1A2AH22 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Ambra1A2AH22 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ambra1A2AH22 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ambra1A2AH22 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ambra1A2AH22 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ambra1A2AH22 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ambra1A2AH22 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ambra1A2AH22 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ambra1A2AH22 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ambra1A2AH22 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ambra1A2AH22 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ambra1A2AH22 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ambra1A2AH22 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ambra1A2AH22 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ambra1A2AH22 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ambra1A2AH22 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ambra1A2AH22 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ambra1A2AH22 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ambra1A2AH22 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ambra1A2AH22 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ambra1A2AH22 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ambra1A2AH22 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ambra1A2AH22 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ambra1A2AH22 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Ambra1A2AH22 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ambra1A2AH22 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ambra1A2AH22 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ambra1A2AH22 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ambra1A2AH22 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms