Protein–RNA interactions for Protein: A2AG10

Nup62cl, Nucleoporin 62 C-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62clA2AG10 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nup62clA2AG10 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nup62clA2AG10 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nup62clA2AG10 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nup62clA2AG10 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nup62clA2AG10 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nup62clA2AG10 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nup62clA2AG10 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nup62clA2AG10 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nup62clA2AG10 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nup62clA2AG10 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nup62clA2AG10 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nup62clA2AG10 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup62clA2AG10 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup62clA2AG10 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup62clA2AG10 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup62clA2AG10 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup62clA2AG10 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup62clA2AG10 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup62clA2AG10 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup62clA2AG10 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup62clA2AG10 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup62clA2AG10 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup62clA2AG10 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nup62clA2AG10 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nup62clA2AG10 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nup62clA2AG10 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nup62clA2AG10 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup62clA2AG10 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup62clA2AG10 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup62clA2AG10 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup62clA2AG10 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup62clA2AG10 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup62clA2AG10 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup62clA2AG10 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup62clA2AG10 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup62clA2AG10 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup62clA2AG10 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup62clA2AG10 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup62clA2AG10 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup62clA2AG10 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup62clA2AG10 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup62clA2AG10 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup62clA2AG10 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup62clA2AG10 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup62clA2AG10 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup62clA2AG10 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup62clA2AG10 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nup62clA2AG10 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nup62clA2AG10 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nup62clA2AG10 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nup62clA2AG10 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup62clA2AG10 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup62clA2AG10 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup62clA2AG10 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nup62clA2AG10 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nup62clA2AG10 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nup62clA2AG10 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nup62clA2AG10 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup62clA2AG10 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup62clA2AG10 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup62clA2AG10 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup62clA2AG10 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup62clA2AG10 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup62clA2AG10 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup62clA2AG10 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup62clA2AG10 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup62clA2AG10 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup62clA2AG10 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup62clA2AG10 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup62clA2AG10 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup62clA2AG10 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup62clA2AG10 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup62clA2AG10 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup62clA2AG10 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup62clA2AG10 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup62clA2AG10 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup62clA2AG10 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup62clA2AG10 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup62clA2AG10 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup62clA2AG10 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup62clA2AG10 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup62clA2AG10 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup62clA2AG10 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup62clA2AG10 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup62clA2AG10 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup62clA2AG10 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nup62clA2AG10 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nup62clA2AG10 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup62clA2AG10 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup62clA2AG10 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup62clA2AG10 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup62clA2AG10 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup62clA2AG10 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup62clA2AG10 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup62clA2AG10 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup62clA2AG10 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup62clA2AG10 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nup62clA2AG10 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nup62clA2AG10 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.1 ms