Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH2

Ube2dnl2, Similar to ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl2A2AFH2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ube2dnl2A2AFH2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ube2dnl2A2AFH2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ube2dnl2A2AFH2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ube2dnl2A2AFH2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ube2dnl2A2AFH2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ube2dnl2A2AFH2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ube2dnl2A2AFH2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ube2dnl2A2AFH2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ube2dnl2A2AFH2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ube2dnl2A2AFH2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ube2dnl2A2AFH2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ube2dnl2A2AFH2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ube2dnl2A2AFH2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ube2dnl2A2AFH2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ube2dnl2A2AFH2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ube2dnl2A2AFH2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ube2dnl2A2AFH2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ube2dnl2A2AFH2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ube2dnl2A2AFH2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ube2dnl2A2AFH2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ube2dnl2A2AFH2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ube2dnl2A2AFH2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ube2dnl2A2AFH2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ube2dnl2A2AFH2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ube2dnl2A2AFH2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ube2dnl2A2AFH2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ube2dnl2A2AFH2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ube2dnl2A2AFH2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ube2dnl2A2AFH2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ube2dnl2A2AFH2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ube2dnl2A2AFH2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ube2dnl2A2AFH2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ube2dnl2A2AFH2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ube2dnl2A2AFH2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ube2dnl2A2AFH2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ube2dnl2A2AFH2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ube2dnl2A2AFH2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ube2dnl2A2AFH2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ube2dnl2A2AFH2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ube2dnl2A2AFH2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ube2dnl2A2AFH2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ube2dnl2A2AFH2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ube2dnl2A2AFH2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ube2dnl2A2AFH2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ube2dnl2A2AFH2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ube2dnl2A2AFH2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ube2dnl2A2AFH2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ube2dnl2A2AFH2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ube2dnl2A2AFH2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ube2dnl2A2AFH2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ube2dnl2A2AFH2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ube2dnl2A2AFH2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ube2dnl2A2AFH2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ube2dnl2A2AFH2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ube2dnl2A2AFH2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ube2dnl2A2AFH2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ube2dnl2A2AFH2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ube2dnl2A2AFH2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ube2dnl2A2AFH2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ube2dnl2A2AFH2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ube2dnl2A2AFH2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ube2dnl2A2AFH2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ube2dnl2A2AFH2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ube2dnl2A2AFH2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ube2dnl2A2AFH2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ube2dnl2A2AFH2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ube2dnl2A2AFH2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ube2dnl2A2AFH2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ube2dnl2A2AFH2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ube2dnl2A2AFH2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ube2dnl2A2AFH2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ube2dnl2A2AFH2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ube2dnl2A2AFH2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ube2dnl2A2AFH2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ube2dnl2A2AFH2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ube2dnl2A2AFH2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ube2dnl2A2AFH2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ube2dnl2A2AFH2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ube2dnl2A2AFH2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ube2dnl2A2AFH2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ube2dnl2A2AFH2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ube2dnl2A2AFH2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ube2dnl2A2AFH2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ube2dnl2A2AFH2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ube2dnl2A2AFH2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ube2dnl2A2AFH2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ube2dnl2A2AFH2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ube2dnl2A2AFH2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ube2dnl2A2AFH2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ube2dnl2A2AFH2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ube2dnl2A2AFH2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ube2dnl2A2AFH2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ube2dnl2A2AFH2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ube2dnl2A2AFH2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ube2dnl2A2AFH2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ube2dnl2A2AFH2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ube2dnl2A2AFH2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ube2dnl2A2AFH2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms