Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700023F06RikA2AB62 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700023F06RikA2AB62 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
1700023F06RikA2AB62 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700023F06RikA2AB62 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700023F06RikA2AB62 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700023F06RikA2AB62 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700023F06RikA2AB62 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700023F06RikA2AB62 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700023F06RikA2AB62 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700023F06RikA2AB62 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700023F06RikA2AB62 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700023F06RikA2AB62 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700023F06RikA2AB62 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700023F06RikA2AB62 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700023F06RikA2AB62 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
1700023F06RikA2AB62 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700023F06RikA2AB62 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700023F06RikA2AB62 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700023F06RikA2AB62 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700023F06RikA2AB62 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700023F06RikA2AB62 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700023F06RikA2AB62 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700023F06RikA2AB62 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700023F06RikA2AB62 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700023F06RikA2AB62 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700023F06RikA2AB62 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700023F06RikA2AB62 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700023F06RikA2AB62 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700023F06RikA2AB62 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700023F06RikA2AB62 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700023F06RikA2AB62 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700023F06RikA2AB62 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
1700023F06RikA2AB62 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
1700023F06RikA2AB62 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
1700023F06RikA2AB62 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700023F06RikA2AB62 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700023F06RikA2AB62 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700023F06RikA2AB62 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700023F06RikA2AB62 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700023F06RikA2AB62 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700023F06RikA2AB62 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
1700023F06RikA2AB62 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700023F06RikA2AB62 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
1700023F06RikA2AB62 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700023F06RikA2AB62 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700023F06RikA2AB62 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700023F06RikA2AB62 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700023F06RikA2AB62 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700023F06RikA2AB62 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700023F06RikA2AB62 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700023F06RikA2AB62 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700023F06RikA2AB62 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700023F06RikA2AB62 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700023F06RikA2AB62 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700023F06RikA2AB62 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700023F06RikA2AB62 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700023F06RikA2AB62 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700023F06RikA2AB62 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700023F06RikA2AB62 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700023F06RikA2AB62 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700023F06RikA2AB62 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700023F06RikA2AB62 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700023F06RikA2AB62 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700023F06RikA2AB62 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700023F06RikA2AB62 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700023F06RikA2AB62 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700023F06RikA2AB62 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700023F06RikA2AB62 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700023F06RikA2AB62 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700023F06RikA2AB62 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700023F06RikA2AB62 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700023F06RikA2AB62 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700023F06RikA2AB62 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700023F06RikA2AB62 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700023F06RikA2AB62 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700023F06RikA2AB62 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700023F06RikA2AB62 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700023F06RikA2AB62 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700023F06RikA2AB62 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700023F06RikA2AB62 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700023F06RikA2AB62 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700023F06RikA2AB62 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700023F06RikA2AB62 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
1700023F06RikA2AB62 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700023F06RikA2AB62 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700023F06RikA2AB62 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700023F06RikA2AB62 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700023F06RikA2AB62 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
1700023F06RikA2AB62 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700023F06RikA2AB62 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700023F06RikA2AB62 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700023F06RikA2AB62 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700023F06RikA2AB62 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700023F06RikA2AB62 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700023F06RikA2AB62 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700023F06RikA2AB62 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
1700023F06RikA2AB62 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700023F06RikA2AB62 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700023F06RikA2AB62 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms