Protein–RNA interactions for Protein: A2A9G7

Shisal2a, Protein shisa-like-2A, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2aA2A9G7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Shisal2aA2A9G7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Shisal2aA2A9G7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Shisal2aA2A9G7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Shisal2aA2A9G7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Shisal2aA2A9G7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Shisal2aA2A9G7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Shisal2aA2A9G7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Shisal2aA2A9G7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Shisal2aA2A9G7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Shisal2aA2A9G7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Shisal2aA2A9G7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Shisal2aA2A9G7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Shisal2aA2A9G7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Shisal2aA2A9G7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Shisal2aA2A9G7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Shisal2aA2A9G7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Shisal2aA2A9G7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Shisal2aA2A9G7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Shisal2aA2A9G7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Shisal2aA2A9G7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Shisal2aA2A9G7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Shisal2aA2A9G7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Shisal2aA2A9G7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Shisal2aA2A9G7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Shisal2aA2A9G7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Shisal2aA2A9G7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Shisal2aA2A9G7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Shisal2aA2A9G7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Shisal2aA2A9G7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Shisal2aA2A9G7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Shisal2aA2A9G7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Shisal2aA2A9G7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Shisal2aA2A9G7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Shisal2aA2A9G7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shisal2aA2A9G7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shisal2aA2A9G7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shisal2aA2A9G7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shisal2aA2A9G7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shisal2aA2A9G7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shisal2aA2A9G7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Shisal2aA2A9G7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shisal2aA2A9G7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shisal2aA2A9G7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Shisal2aA2A9G7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Shisal2aA2A9G7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Shisal2aA2A9G7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Shisal2aA2A9G7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Shisal2aA2A9G7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Shisal2aA2A9G7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Shisal2aA2A9G7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Shisal2aA2A9G7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Shisal2aA2A9G7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Shisal2aA2A9G7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Shisal2aA2A9G7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Shisal2aA2A9G7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Shisal2aA2A9G7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Shisal2aA2A9G7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Shisal2aA2A9G7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Shisal2aA2A9G7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Shisal2aA2A9G7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Shisal2aA2A9G7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Shisal2aA2A9G7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Shisal2aA2A9G7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Shisal2aA2A9G7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Shisal2aA2A9G7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Shisal2aA2A9G7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Shisal2aA2A9G7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Shisal2aA2A9G7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Shisal2aA2A9G7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Shisal2aA2A9G7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Shisal2aA2A9G7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Shisal2aA2A9G7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Shisal2aA2A9G7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Shisal2aA2A9G7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Shisal2aA2A9G7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Shisal2aA2A9G7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Shisal2aA2A9G7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Shisal2aA2A9G7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Shisal2aA2A9G7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Shisal2aA2A9G7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Shisal2aA2A9G7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Shisal2aA2A9G7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Shisal2aA2A9G7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Shisal2aA2A9G7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Shisal2aA2A9G7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Shisal2aA2A9G7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Shisal2aA2A9G7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Shisal2aA2A9G7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Shisal2aA2A9G7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Shisal2aA2A9G7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Shisal2aA2A9G7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Shisal2aA2A9G7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Shisal2aA2A9G7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shisal2aA2A9G7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shisal2aA2A9G7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shisal2aA2A9G7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shisal2aA2A9G7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shisal2aA2A9G7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shisal2aA2A9G7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms