Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNU5

E130218I03Rik, RIKEN cDNA E130218I03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E130218I03RikA0A0U1RNU5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E130218I03RikA0A0U1RNU5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E130218I03RikA0A0U1RNU5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E130218I03RikA0A0U1RNU5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E130218I03RikA0A0U1RNU5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E130218I03RikA0A0U1RNU5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E130218I03RikA0A0U1RNU5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms