Protein–RNA interactions for Protein: A0A0M3U1B0

Sycp2l, Synaptonemal complex protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sycp2lA0A0M3U1B0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sycp2lA0A0M3U1B0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sycp2lA0A0M3U1B0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sycp2lA0A0M3U1B0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sycp2lA0A0M3U1B0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sycp2lA0A0M3U1B0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sycp2lA0A0M3U1B0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sycp2lA0A0M3U1B0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sycp2lA0A0M3U1B0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sycp2lA0A0M3U1B0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sycp2lA0A0M3U1B0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sycp2lA0A0M3U1B0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sycp2lA0A0M3U1B0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sycp2lA0A0M3U1B0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sycp2lA0A0M3U1B0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sycp2lA0A0M3U1B0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sycp2lA0A0M3U1B0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sycp2lA0A0M3U1B0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Sycp2lA0A0M3U1B0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sycp2lA0A0M3U1B0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sycp2lA0A0M3U1B0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sycp2lA0A0M3U1B0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sycp2lA0A0M3U1B0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sycp2lA0A0M3U1B0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sycp2lA0A0M3U1B0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sycp2lA0A0M3U1B0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sycp2lA0A0M3U1B0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sycp2lA0A0M3U1B0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sycp2lA0A0M3U1B0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sycp2lA0A0M3U1B0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sycp2lA0A0M3U1B0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sycp2lA0A0M3U1B0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sycp2lA0A0M3U1B0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sycp2lA0A0M3U1B0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Sycp2lA0A0M3U1B0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sycp2lA0A0M3U1B0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Sycp2lA0A0M3U1B0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sycp2lA0A0M3U1B0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sycp2lA0A0M3U1B0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sycp2lA0A0M3U1B0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sycp2lA0A0M3U1B0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sycp2lA0A0M3U1B0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sycp2lA0A0M3U1B0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sycp2lA0A0M3U1B0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sycp2lA0A0M3U1B0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sycp2lA0A0M3U1B0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sycp2lA0A0M3U1B0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sycp2lA0A0M3U1B0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sycp2lA0A0M3U1B0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sycp2lA0A0M3U1B0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms