Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ99

Gm29666, Predicted gene 29666, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29666A0A087WQ99 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm29666A0A087WQ99 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm29666A0A087WQ99 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm29666A0A087WQ99 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm29666A0A087WQ99 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm29666A0A087WQ99 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm29666A0A087WQ99 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm29666A0A087WQ99 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm29666A0A087WQ99 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm29666A0A087WQ99 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm29666A0A087WQ99 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm29666A0A087WQ99 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm29666A0A087WQ99 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm29666A0A087WQ99 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm29666A0A087WQ99 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm29666A0A087WQ99 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm29666A0A087WQ99 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm29666A0A087WQ99 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm29666A0A087WQ99 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm29666A0A087WQ99 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm29666A0A087WQ99 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm29666A0A087WQ99 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm29666A0A087WQ99 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm29666A0A087WQ99 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm29666A0A087WQ99 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm29666A0A087WQ99 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm29666A0A087WQ99 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm29666A0A087WQ99 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm29666A0A087WQ99 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm29666A0A087WQ99 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm29666A0A087WQ99 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm29666A0A087WQ99 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm29666A0A087WQ99 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm29666A0A087WQ99 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm29666A0A087WQ99 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm29666A0A087WQ99 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm29666A0A087WQ99 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm29666A0A087WQ99 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm29666A0A087WQ99 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm29666A0A087WQ99 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm29666A0A087WQ99 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm29666A0A087WQ99 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm29666A0A087WQ99 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm29666A0A087WQ99 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm29666A0A087WQ99 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm29666A0A087WQ99 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm29666A0A087WQ99 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm29666A0A087WQ99 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm29666A0A087WQ99 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm29666A0A087WQ99 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm29666A0A087WQ99 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm29666A0A087WQ99 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm29666A0A087WQ99 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm29666A0A087WQ99 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm29666A0A087WQ99 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm29666A0A087WQ99 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm29666A0A087WQ99 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm29666A0A087WQ99 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm29666A0A087WQ99 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm29666A0A087WQ99 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm29666A0A087WQ99 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm29666A0A087WQ99 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm29666A0A087WQ99 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm29666A0A087WQ99 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm29666A0A087WQ99 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm29666A0A087WQ99 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm29666A0A087WQ99 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm29666A0A087WQ99 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm29666A0A087WQ99 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm29666A0A087WQ99 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm29666A0A087WQ99 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm29666A0A087WQ99 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm29666A0A087WQ99 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm29666A0A087WQ99 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm29666A0A087WQ99 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm29666A0A087WQ99 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm29666A0A087WQ99 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm29666A0A087WQ99 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm29666A0A087WQ99 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm29666A0A087WQ99 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm29666A0A087WQ99 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm29666A0A087WQ99 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm29666A0A087WQ99 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm29666A0A087WQ99 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm29666A0A087WQ99 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm29666A0A087WQ99 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm29666A0A087WQ99 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm29666A0A087WQ99 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm29666A0A087WQ99 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm29666A0A087WQ99 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm29666A0A087WQ99 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm29666A0A087WQ99 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm29666A0A087WQ99 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm29666A0A087WQ99 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm29666A0A087WQ99 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm29666A0A087WQ99 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm29666A0A087WQ99 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm29666A0A087WQ99 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm29666A0A087WQ99 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm29666A0A087WQ99 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms