Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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PTPRTO14522 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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PTPRTO14522 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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PTPRTO14522 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
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PTPRTO14522 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
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PTPRTO14522 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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PTPRTO14522 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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PTPRTO14522 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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