Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
KLF9Q13886 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.4 ms