Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.14
PTPN13Q12923 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
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