Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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